BIOZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN!
|
|
- Emilie Nygaard
- 8 år siden
- Visninger:
Transkript
1 BIZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN! FAGLIG BAGGRUND For at få det maksimale udbytte af denne øvelse er det en forudsætning, at teorien bag enzymer, enzymkinetik og resistensmekanismer er bekendt. Hertil kan bl.a. henvises til kapitlet om antibiotika og resistens i Bioteknologiske Horisonter samt indlægget om enzymkinetik skrevet af Hans Christian Jensen, Ulla Christensen og Jakob Schiødt (tilgængeligt på
2 FRMÅL G BAGGRUND Formålet med øvelsen er at bestemme, hvilke stoffer eller betingelser, der kan hæmme enzymet β-lactamase, og dermed forhindre baterievækst, når der er antibiotika til stede. Dette gøres ved at teste aktiviteten af β-lactamasen på agarplader, der indeholder antibiotikaet ampicillin. Ampicillin er ofte brugt i forskning til at holde uønsket bakterievækst nede. Se faktaboks 1. Når man kloner gener ind i bakterier, kan man bruge resistens til at selektere bakterier. Hvis tilsætning af β-lactamasen tillader bakterievækst, er enzymet aktivt og uhæmmet. FAKTABKS 1 RESISTENS I FRSKNING I forskning kan det til tider være en fordel at gøre sine celler resistente, når man kloner. På denne måde kan man gro dem op i et medie, der indeholder antibiotikum og forhindre alle andre mikroorganismer, der ellers også ville gro under disse omstændigheder, fra at overleve. Figur 1: Grundstrukturen af penicilliner. R er den del af penicillinen, der kan variere. β-lactam-ringen er fremævet med rød. FAKTABKS 2 Β-LACTAMASE β-lactam-ringe er firledede ringe, der udgør kernen i størstedelen af antibiotika, der bliver brugt i dag, inklusiv penicilliner, figur 1. β-lactamase er et enzym der ødelægger denne firledede ring. Udtrykkelsen af dette enzym kan være med til at gøre bakterier resistente over for en bred vifte af forskellige antibiotika. Antibiotika bruges til at bekæmpe bakterielle infektioner. β-lactam antibiotika virker ved at hæmme enzymer, der er ansvarlige for dannelse af bakteriens cellevæg. Disse enzymer hedder transpeptidaser. Ved at hæmme disse enzymer stoppes celledeling, og bakterien dør. Som et forsvar mod β-lactam antibiotika har bakterier videreudviklet den klasse af enzymer, der hedder β-lactamaser. En β-lactamase katalyserer hydrolysen af β-lactam-ringe ved et nukleofilt angreb på carbonyl carbon (angivet med en stjerne i figur 1). Derved åbnes den firledede ring, figur 2. Når β-lactam-ringen er åbnet, har antibiotikaene mistet deres virkning og kan derfor ikke længere hæmme transpeptidaserne (se faktaboks 3 om hydrolse og hydrolaser). 2
3 FRMÅL G BAGGRUND R NH N S R Beta-lactamase H2 Det er ikke alle bakterier med β-lactamaser, der udgør en sygdomstrussel og derned er patogene. Derimod ved vi, at alle patogene bakterier har β-lactamaser. For at bekæmpe patogene bakterier, benyttes kombinationer af stoffer og/eller der udvikles ny antibiotika. De patogene bakterier er i stand til at forsvare sig mod sådanne tiltag ved at tilpasse det gen, der koder for β-lactamase og dermed det protein, der bliver udtrykt. Denne tilpasning sker enten ved hjælp af mutationer i den β-lactamase, bakterien allerede har, eller ved horisontal gen-overførsel fra en bakterie, der har genet, til en bakterie der ikke har. De nye β-lactamaser har aktivitet på andre substrater og tilpasser sig hurtigt nye miljøer. Bakteriernes primære forsvar mod antibiotika er derfor dannelsen af nye β-lactamaser. Evnen til hurtigt at danne nye β-lactamaser skyldes det evolutionære pres, der påhviler bakterierne for at overleve survival of the fittest bacterium! Det er smart for bakterien, men ikke smart for behandlingen af bakterielle infektioner. Ved at danne nye β-lactamaser bliver bakterierne resistente overfor antibiotika, der før kunne afhjælpe en infektion. Hvis bakterien bliver resistent overfor et bredt spektrum af antibiotika, siges den at være multiresistent. Multiresistente bakterier er et stort problem på bl.a. hospitaler. R NH H NH S R Figur 2: Reaktionen katalyseret af β-lactamase. β-lactamasen katalyserer hydrolosen af β-lactama-ringe. FAKTABKS 3 HYDRLYSE G HYDRLASER Når et molekyle hydrolyseres, spaltes dette molekyle i to vha. et vandmolekyle (af latin, hydro - vand og lysere - spalte). Et enzym, der katalyserer en hydrolyse, hedder en hydrolase. Den tilfældige (spontane) hydrolyse af β-lactamer er meget langsom. For at have bedre chancer for at overleve antibiotika har visse bakterieceller altså udviklet enzymer, der kan øge tempoet hvormed β-lactam-stofferne hydrolyseres. Disse enzymer hedder β-lactamaser. β-lactamaser er altså en underklasse af hydrolaserne. I denne øvelse skal I afprøve aktiviteten af β-lactamasen, når den udsættes for forskellige behandlinger. Det betyder praktisk, at I skal undersøge om β-lactamasen er i stand til at katalysere åbningen af β-lactam-ringen under forskellige betingelser. Dette kan visualiseres ved at undersøge E. colis evne til at overleve på en agarplade, hvor der er tilsat en β-lactam antibiotika i vækstmediet. I skal først udsætte β-lactamasen for forskellige betingelser, der kan ødelægge dens tredimensionelle struktur, tilstoppe dets aktive site, eller på anden vis stresse proteinet kemisk. Efter I har udsat den for bl.a. opvarmning, reduktionsmiddel, denaturant eller proteaser, skal I påsætte små ringe af β-lactamasen (spotte) på pladen i forskellige koncentrationer. Bagefter skal I, ovenpå β-lactamase-spotten, sætte levende E. coli-celler. Hvis der, på trods af at der er væksthæmmer i form af antibiotika i agarmediet, alligevel vokser E. coli kolonier op, der hvor I har spottet β-lactamase, så er β-lactamasen aktiv og kan beskytte E. coli mod ampicillinen, se figur 3 på næste side. 3
4 FRMÅL G BAGGRUND Figur 3: Pladeassay. Pladeassayet virker som angivet på figuren ovenfor; en LB-agarplade med antibiotika spottes med den β-lactamase, I vil afprøve aktiviteten af. Hvis β- lactamasen er katalytisk aktiv, vil E. coli cellerne, der spottes ovenpå, overleve (øverst). Hvis β-lactamasen er inaktiv, vil I ikke se nogen bakterievækst (nederst). Et typisk resultat af pladeassayet kan se ud som på Figur 4. Her er der i de øvrige forsøg anvendt andre proteiner, der ikke er enzymer og derfor ikke kan angribe ampicillinen. Figur 4: Pladeassay med ikkeβ-lactamaser. Følgende proteiners evne til at katalysere åbningen af β-lactam-ringen blev undersøgt i de angivne koncentrationer (2 μg, 0,2 μg, 0,02 μg og 0,002 μg): β-lactamase (positiv kontrol); ovalbumin; lysozym; og β-lactoglobulin. Det ses af dette pladeassay, at kun β-lactamasen er i stand til at katalysere åbningen af β-lactam-ringen, symboliseret ved de hvide bakteriekolonier. 4
5 FRMÅL G BAGGRUND Som det kan ses af figur 4, vokser bakterierne gerne, når der tilsættes β-lactamasen (de hvide spots), hvorimod der ikke er nogen bakterier, der kan gro ved de tre andre proteinspots. I kan også bemærke, at der er lavet en serie af forsøg, hvor β-lactamasen er tilsat i forskellig koncentrationer. Hertil skal I bruge en fortyndingsrække. Denne fremstilles som vist i figur 5. Figur 5: Fremstilling af fortyndinger. 5
6 FREMGANGSMÅDE FREMSTILLING AF AGARPLADER Agaren opvarmes til ca. 60 C enten vha. mikroovn eller vandbad. Hvis mikroovn benyttes, skal I være forsigtige med at bruge for høj effekt over for lang tid, da agaren så vil stødkoge. Vi anbefaler, at I prøver jer frem ved en meget lav frekvens i korte tidsrum. Sæt en streg på jeres petriskåle, der markerer ca. 1 cm fra bunden. Når agaren er varmet op, hælder I det forsigtigt ned i en petriskål, til det når den markerede streg. Petriskålen vil have et låg. Det er den med den største omkreds. Sørg derfor for at hælde agar i bunden. For at undgå at der kommer alt for mange luftbobler i agaren, skal I hælde med en konstant hastighed. Agarpladen stilles til tørring med låget halvt på. Tørringen tager ca. 30 minutter. AKTIVITETSASSAY Mens agarpladerne tørrer, kan I gøre jeres β-lactamase opløsninger klar. Hvert hold undersøger en forudbestemt betingelse samt en bestemmelse efter eget ønske (jeres egen medicin ). Start med at opmærke 10 Eppendorfrør: fem til den forudbestemte betingelse og fem til jeres eget forslag. Fra en udleveret stamopløsning af β- lactamase laves en fortyndingsserie som vist overfor i de fem opmærkede Eppendorfrør. På den måde får I et indtryk af, hvor meget enzym der skal til for, at bakterien vil overleve tilstedeværelsen af antibiotika. BETINGELSER Når I har fremstillet jeres 10 rør, er I klar til at undersøge om β-lactamase kan give vækstbetingelse til bakterierne. I skal derfor undersøge under hvilke betingelser β-lactamasen er katalytisk aktiv, det vil sige kan hydrolysere en β-lactam-ring. Som nævnt tidligere skal dette undersøges ved at teste E. colis overlevelsesevne på β-lactamase spots. Når I har udsat β-lactamasen for den ønskede behandling (se forslagsliste nedenfor), skal I forsigtigt afsætte 5 μl β-lactamase på en agarplade fra hver fortynding, helst så det danner en cirkel. Lad spotten tørre i 5-10 minutter, enten på bordet eller ved at sætte det ind ved 37 C. Efter tørring påsættes 5 μl levende E. coli-celler ovenpå β-lactamase-spotten. Lad igen spotten tørre. Stil (inkuber) pladen ved 37 C natten over eller 48 timer ved stuetemperatur. Efter inkubationen vil det være tydeligt at se, om der er vækst eller ej, og dermed om β-lactamase har bevaret sin katalytiske aktivitet. Der, hvor β-lactamasen ikke er slået ud, men fortsat er aktiv, vil der gro bakterier, så der dannes et tæppe af cellekolonier. Der, hvor β-lactamase er katalytisk inaktiv, vil bakterierne ikke kunne gro. Når man laver forsøg som dette, er det vigtigt at have en positiv og en negativ kontrol. Dette er henholdsvis et forsøg, hvor man er sikker på, at dét stof man bruger virker og sikker på, at det stof man bruger ikke virker. Udtænk, hvordan disse forsøg skal sættes op? DET SKAL I BRUGE: BUFFERE G PLØSNINGER 2 mg/ml β-lactamase opløst i 50 mm fosfatbuffer ph 7 (kan enten købes som frysetørret pulver eller oprenses) 50 mm Tris-HCl ph 7 1 l LB-agar med 100 µg/ml ampicillin tilsat (nok til ca. 20 agarplader) 8 M urea Gentamycin Ampicillin opløst i milli-q vand til 100 mg/ml 1 M β-mercaptoethanol 1 M dithioreitol 0.25 M EDTA Din egen ubekendte faktor/ medicin kun fantasien sætter grænser (kaffe, cola, vaskepulver, sulfo etc) MATERIALE G APPARATUR Petriskåle afhænger af antallet af grupper og antallet af betingelser man ønsker undersøgt 10 µl pipetter, 1 ml pipetter per hold og pipettespidser Eppendorfrør til blandinger E. coli stamme uden B-lactamase aktivitet (f.eks. DH5a ) 37 C varmeskab Evt. varmeblok Mikrobølgeovn Handsker, kitler og sikkerhedsbriller 6
7 FREMGANGSMÅDE MULIGE BEHANDLINGER AF β-lactamasen TIL AKTIVITETSASSAYET: Hvert hold får én af betingelserne 1-9 samt en valgfri mulighed: 1. Native forhold det vil sige, at β-lactamasen er korrekt foldet og ved ph 7 2. Efter inkubation i 6 M urea i 5 minutter 3. Efter opvarmning til 95 C i fem minutter 4. Efter opvarmning til 95 C i fem minutter tilsat 5 mm β-mercaptoethanol eller DTT (dithiotreitol) 5. β-lactam antibiotika som ampicillin, carbenicillin, spectomycin, gentamycin, kanamycin, etc. 6. Tilsæt en protease, eksempelvis trypsin 7. Tilsæt spyt 8. Din egen medicin (cola, kaffe, opløst vaskepulver, gødning, etc) NEDENSTÅENDE SKEMA UDFYLDES EFTER FRSØGET: BETINGELSE FRTYNDING 1 FRTYNDING 2 FRTYNDING 3 FRTYNDING 4 FRTYNDING
8 SPØRGSMÅL TIL ØVELSEN SPØRGSMÅL TIL ØVELSEN 1. Spørgsmål Var der nogen 1 betingelser der tillod bakterievækst? Hvilke? 2. Spørgsmål Var der nogen 2 betingelser der ikke tillod bakterievækst? Hvilke? 3. Spørgsmål Hvad var begrundelsen 3 for jeres valg af betingelse? 4. Spørgsmål Hvilket forsøg 4 ville du lave for at sikre, at dit forsøg virker? (den postive og den negative kontrol) 5. Spørgsmål Hvad er en 5protease, og hvordan virker den? 6. Spørgsmål Hvorfor tilsætter 6 man ampicillin til agaren? 7. Spørgsmål Hvorledes vil 7 I formode, at ampicillin og gentamycin adskiller sig fra hinanden? 8. Spørgsmål Hvorfor er kun 8 nogle bakterier patogene og andre ikke? 9. Hvordan virker gentamycin? 8
9 NTER 9
BIOZYMER ØVELSE 1 ENZYMKINETIK
BIZYME ØVELE 1 EZYMKIETIK FAGLIG BAGGUD Det forudsættes, at teorien bag enzymer og enzymkinetik er bekendt. ertil kan bl.a. henvises til kapitlet om antibiotika og resistens i Bioteknologiske orisonter,
Læs mereRegnskovens hemmeligheder
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Regnskovens hemmeligheder Øvelsesvejledning Formål Et gen for et kræfthelbredende protein er blevet fundet i nogle mystiske blade i regnskoven. Forskere
Læs mereMælkesyrebakterier og holdbarhed
Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge holdbarheden af kød ved at: 1. Undersøge forskellen på bakterieantal
Læs mereDette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages gerne. Kh Claudia.
Transformation af E.coli K 12 Version 3. marts 2009 (C) Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages
Læs mereUdvikling af ny medicin
Udvikling af ny medicin Formål: Formålet med denne øvelse er at fremstille 9 forskellige kemiske stoffer og teste dem for at undersøge om der er en antibiotikavirkning af nogen af dem ved metoden kombinatorisk
Læs mereMælkesyrebakterier og holdbarhed
Mælkesyrebakterier og holdbarhed Navn: Forsøgsvejledning Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål med forsøget Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge
Læs mereFind enzymer til miljøvenligt vaskepulver
Find enzymer til miljøvenligt vaskepulver Enzymer, der er aktive under kolde forhold, har adskillige bioteknologiske anvendelsesmuligheder. Nye smarte og bæredygtige produkter kan nemlig blive udviklet
Læs mereBiotechnology Explorer. Regnskovens hemmelighed
Biotechnology Explorer Regnskovens hemmelighed Katalognummer 166-0006-EDU explorer.bio-rad.com For teknisk service bedes du ringe til dit lokale Bio-Rad kontor Office or in the U.S. Call 1-800-4BIORAD
Læs mereKapitel 1 Genteknologi (1/6)
Kapitel 1 Genteknologi (1/6) Transformation FOTO: SØREN LUNDBERG FORMÅL At isolere plasmider fra plasmidbærende bakterier og overføre dem til andre bakterier. TEORI Transformation er den teknik, hvor generne
Læs mereElevvejledning pglo transformation
Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer
Læs mereKonkurrence mellem to bakteriearter
1 Biologi-forsøg: Populationsbiologi/evolution Konkurrence mellem to bakteriearter Forsøget undersøger, hvordan en ydre miljøfaktor (temperatur) påvirker konkurrencen mellem to forskellige arter. I dette
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Green Fluorescent Protein (GFP) Oprensnignskit Katalognummer 166-0005-EDU www.bio-rad.com For teknisk service bedes du ringe til dit lokale Bio-Rad kontor Office or in the U.S. Call
Læs mereØvelse med tarmkræftceller i kultur.
Øvelse med tarmkræftceller i kultur. Baggrund Hver 3. dansker bliver ramt af kræft, inden de er blevet 75 år. Tyktarmskræft er den 3. hyppigste kræftform hos både mænd og kvinder, hvor henholdsvis 7.3
Læs mereGreen Fluorescent Protein (GFP) Oprensning af GFP
1 Green Fluorescent Protein (GFP) Oprensning af GFP Katalognummer 166-0005EDU www.biorad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium Revideret februar 2010. Kontakt: Birgitjustesen@gmail.com
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mere[BESØGSSERVICE INSTITUT FOR MOLEKYLÆRBIOLOGI OG GENETIK, AU]
Enzymkinetik INTRODUKTION Enzymer er biologiske katalysatorer i alle levende organismer som er essentielle for liv. Selektivt og effektivt katalyserer enzymerne kemiske reaktioner som ellers ikke ville
Læs mereForsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier
Forsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier Formål: at undersøge udviklingen i mængden af tilsatte patogene bakterier til hønsegødning.
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs merepglo-transformationskit
1 Katalog nummer 166-0003-EDU www.bio-rad.com pglo-transformationskit arac ori pglo bla GFP Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen og Lars Moeslund, 2007 Revideret november 2009. Kontakt:
Læs mereUndersøgelse af forskellige probiotiske stammer
Undersøgelse af forskellige probiotiske stammer Formål Formålet med denne øvelse er: 1. At undersøge om varer med probiotika indeholder et tilstrækkeligt antal probiotiske bakterier, dvs. om antallet svarer
Læs mereBIOZYMER ØVELSE 2 OPRENSNING AF PROTEINER
BIOZYMER ØVELSE 2 OPRENSNING AF PROTEINER FAGLIG BAGGRUND Det forudsættes, at den grundlæggende teori bag rekombinant protein ekspression og proteinopresning er bekendt. For dette henvises til undervisningsmateriale
Læs mereAnalyse af proteiner Øvelsesvejledning
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Formål At separere og analysere proteiner i almindelige fødevarer ved brug af gelelektroforese. Teori Alle dele
Læs mereSom substrat i forsøgene anvender vi para nitrophenylfosfat, der vha. enzymet omdannes til paranitrofenol
Enzymkinetik Introduktion I disse forsøg skal I arbejde med enzymet alkalisk fosfatase. Fosfataser er meget almindelige i levende organismer og er enzymer med relativt bred substrat specificitet. De katalyserer
Læs mereEfterbehandling til Enzymer - Klip dit tis i stykker CIRKUS NATURLIGVIS
Efterbehandling til Enzymer - Klip dit tis i stykker CIRKUS NATURLIGVIS Enzymer kan godt være svære at forstå, og oplægget indeholder rigtig meget information. Derfor er det en god idé, at lave noget efterbehandling.
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereDNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereBiotechnology Explorer. Protein Fingerprinting
Biotechnology Explorer Protein Fingerprinting Instruktionsmanual Katalognummer 166-0100EDU explorer.bio-rad.com Delene i dette kit er sendt i seperate æsker. Opbevar proteinstandarderne i fryseren, ved
Læs mereBestemmelse af celletal
Bioteknologi 2, Tema 3 Forsøg 4 Bestemmelse af celletal Mange klassiske mikrobiologiske metoder har til formål at undersøge hvor mange mikroorganismer man har i sin prøve. Det undersøger man gennem forskellige
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer pglo Transformationskit Katalognummer 166-0003-EDU explorer.bio-rad.com Dette kit skal opbevares ved stuetemperatur Kopiering af enhver del af dette dokument er kun tilladt til undervisningsbrug
Læs mereMikrobiologiske processer og sundhed
Mikrobiologiske processer og sundhed 1. CASE: Hjælp en landmand med sundhedsproblemer i svinebesætning En landmand, der fodrer sine grise med vådfoder, oplever døde grise og grise med diarre. Han frygter
Læs mereEn forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:
F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs merepglo-transformationskit
Katalog nummer 166-0003-EDU pglo-transformationskit arac ori pglo bla GFP Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen og Lars Moeslund, 2004 Brugen af dette kit til undervisningsbrug skal varetages
Læs mereDNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereOpgave 1 Listeria. mørkviolette bakteriekolonier, se figur 1a. og b. 1. Angiv reaktionstypen for reaktion. 1 vist i figur 1b.
Opgave 1 Listeria Bakterien Listeria monocytogenes kan være sygdomsfremkaldende for personer, der i forvejen er svækkede. For at identificere Listeria kan man anvende indikative agarplader. Her udnyttes
Læs mereBIOTEKNOLOGI HØJT NIVEAU
STUDENTEREKSAMEN 2007 2007-BT-1 BITEKNLGI HØJT NIVEAU Torsdag den 31. maj 2007 kl. 9.00 14.00 Sættet består af 1 stor og 2 små opgaver samt 1 bilag i 2 eksemplarer. Det ene eksemplar af bilaget afleveres
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereFLEXICULT PRODUKTINFORMATION S T A T E N S S E R U M I N S T I T U T. forebygger og bekæmper smitsomme sygdomme og medfødte lidelser
FLEXICULT SSI-urinkit S T A T E N S S E R U M I N S T I T U T forebygger og bekæmper smitsomme sygdomme og medfødte lidelser Statens Serum Institut Artillerivej 5 2300 København S Tlf.: 3268 3268 Fax:
Læs mere[BESØGSSERVICE INSTITUT FOR MOLEKYLÆRBIOLOGI OG GENETIK, AU]
Enzymkinetik INTRODUKTION Enzymer er biologiske katalysatorer i alle levende organismer som er essentielle for liv. Selektivt og effektivt katalyserer enzymerne kemiske reaktioner som ellers ikke ville
Læs mereFormål At analysere for myosin i muskelvæv fra fisk ved brug af western blotting
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Western blotting Øvelsesvejledning Formål At analysere for myosin i muskelvæv fra fisk ved brug af western blotting Teori Proteomik er studiet af celleproteiners
Læs mereFremstilling af ferrofluids
Fremstilling af ferrofluids Eksperiment 1: Fremstilling af ferrofluids - Elevvejledning Formål I dette eksperiment skal du fremstille nanopartikler af magnetit og bruge dem til at lave en magnetisk væske,
Læs mereE 10: Fremstilling af PEC-solceller
E 10: Fremstilling af PEC-solceller Formål Formålet med forsøget er at fremstille PEC (Photo Electro Chemical) solceller ud fra vinduesruder, plantesaft, hvid maling og grafit fra en blyant. Apparatur
Læs mereIsolering af DNA fra løg
Isolering af DNA fra løg Formål: At afprøve en metode til isolering af DNA fra et levende væv. At anvende enzymer.. Indledning: Isolering af DNA fra celler er første trin i mange molekylærbiologiske undersøgelser.
Læs merePuffere. Øvelsens pædagogiske rammer. Sammenhæng. Formål. Arbejdsform: Evaluering
1 Puffere Øvelsens pædagogiske rammer Sammenhæng Denne øvelse er tilpasset kemiundervisningen på modul 3 ved bioanalytikeruddannelsen. Kemiundervisningen i dette modul indeholder blandt andet syrebaseteori
Læs mereRegnskovens hemmelighed
1 Regnskovens hemmelighed Katalognummer 1660006-EDU www.bio-rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium Revideret februar 2010. Kontakt: Birgitjustesen@gmail.com Brugen
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereSTUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER
STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER Navn: Dato:.. MÅL: - Lær om eksistensen af naturlige nanomaterialer - Lysets interaktion med kolloider - Gelatine og mælk som eksempler
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Oprensning af genomisk DNA fra plantemateriale Manual Katalog nr. 166-5005EDU explorer.bio-rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium, februar 2009
Læs mereKemiøvelse 2 1. Puffere
Kemiøvelse 2 1 Puffere Øvelsens pædagogiske rammer Sammenhæng Denne øvelse er tilpasset kemiundervisningen på modul 3 ved bioanalytikeruddannelsen. Kemiundervisningen i dette modul indeholder blandt andet
Læs merePlasmidoprensning med kogemetode Oprensning af plasmid DNA med kogemetode for brug til transformation og restriktionsanalyse
www.volvoxdk.dk C. Girnth-Diamba og B. Fahnøe, 2010 Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Solrød Gymnasium, Solrød Center 2 DK 2680 Solrød Strand, Denmark E: sgcg@solgym.dk og sgbf@solgym.dk Plasmidoprensning
Læs mereKemi A. Studentereksamen. Onsdag den 4. juni 2014. 130512.indd 1 26/02/14 14.00
Kemi A Studentereksamen 2stx141-KEM/A-04062014 nsdag den 4. juni 2014 kl. 9.00-14.00 130512.indd 1 26/02/14 14.00 Side 1 af 10 sider pgavesættet består af 4 opgaver med i alt 16 spørgsmål samt 3 bilag
Læs mereTest Canvas: Eksamen i BMB502 Januar 2012
BMB502, Enzymer og membraner, efterår 11. f Tests, Surveys and Pools Tests Test Canvas : Eksamen i BMB502 Januar 2012 Edit Mode is: Test Canvas: Eksamen i BMB502 Januar 2012 Create Reuse Upload s Settings
Læs mereOpdateret d. 17. august Biosensor. Niveau 1. Øvelsesvejledning
Opdateret d. 17. august 2017 Biosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning Vigtig information om brug af Biosensor-kittet for undervisere Før øvelsen startes er det vigtigt, at underviseren har læst følgende erklæring
Læs mereEr der flere farver i sort?
Er der flere farver i sort? Hvad er kromatografi? Kromatografi benyttes inden for mange forskellige felter og forskningsområder og er en anvendelig og meget benyttet analytisk teknik. Kromatografi bruges
Læs mereEkstraktion af proteiner fra kød, æg og mælkeprodukter
Ekstraktion af proteiner fra kød, æg og mælkeprodukter Udarbejdet af Lektor Lars Haastrup Pedersen, forskningsadjunkt Claus Gyrup Nielsen, Phd. Anders Bundgaard Sørensen, Phd. Malene Bredal Brohus samt
Læs mereAppendix 1: Udregning af mængde cellesuspention til udsåning. Faktor mellem total antal celler og antal celler der ønskes udsås:
Appendix Appendix 1: Udregning af mængde cellesuspention til udsåning Fortyndingsfaktor: Efter trypsinering og centrifugering af celler fra cellestokken, opblandes cellerne i 1 ml medie. For at lave en
Læs mereJernindhold i fødevarer bestemt ved spektrofotometri
Bioteknologi 4, Tema 8 Forsøg www.nucleus.dk Linkadresserne fungerer pr. 1.7.2011. Forlaget tager forbehold for evt. ændringer i adresserne. Jernindhold i fødevarer bestemt ved spektrofotometri Formål
Læs mereKvantitativ bestemmelse af reducerende sukker (glukose)
Kvantitativ bestemmelse af reducerende sukker (glukose) Baggrund: Det viser sig at en del af de sukkerarter vi indtager med vores mad er hvad man i fagsproget kalder reducerende sukkerarter. Disse vil
Læs mereLaboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve
Laboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve Til isolering af genomisk DNA fra indsamlingssætserierne Oragene - og ORAcollect. Du kan finde flere sprog og protokoller på vores webside
Læs merePCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA
PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase
Læs mereBiosensor. by Biotech Academy. Øvelsesvejledning
Biosensor by Biotech Academy Øvelsesvejledning Vigtig information om brug af biosensor kittet for undervisere Før øvelsen startes, er det vigtigt at underviseren har læst følgende erklæring og lærervejledningen,
Læs mereHVAD GØR RØGEN VED KROPPEN?
42 www.op-i-røg.dk GÅ OP I RØG Kræftens Bekæmpelse KAPITEL 5: HVAD GØR RØGEN VED KROPPEN? www.op-i-røg.dk 43 Kapitel 5: Indhold Dette kapitel tager udgangspunkt i, hvad der sker med røgen i kroppen på
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Genes in a Bottle Kit DNA Extraction Module Lav et halssmykke med dit eget DNA Katalognr.: 166-2000EDU Dertil kan man købe ekstradele, hvis der skal laves halskæder til eleverne.
Læs mereDesinfektion - overordnet set
Desinfektion - overordnet set Temadag for Hygiejnekontaktpersoner 31. marts 2014 Bodil Forman Hygiejnesplejerske Stigende antibiotikaforbrug til mennesker og dyr her i landet har bevirket en stigende forekomst
Læs mereUndervisningsbeskrivelse
Undervisningsbeskrivelse Stamoplysninger til brug ved prøver til gymnasiale uddannelser Termin Institution Uddannelse Fag og niveau Lærer(e) Termin hvori undervisningen afsluttes: maj-juni, 2013 Skive
Læs mereKOSMOS. 7.1 Spaltning af sukker. Materialer MADENS KEMI KEMISKE STOFFER I MADEN DISACCHARIDER
KEMISKE STOFFER I MADEN DISACCHARIDER 7.1 Spaltning af sukker I skal undersøge, hvordan sukker spaltes ved kontakt med en syre. Almindelig hvidt sukker er et disaccharid. Det kan spaltes i to monosaccharider:
Læs mereFLEXICULT VET URINTEST. SSI Diagnostica
FLEXICULT VET URINTEST SSI Diagnostica Udarbejdet af Tanja Rasmussen, Dyrlæge Mette Kerrn, Cand.Pharm., PhD Aase Meyer, produktspecialist Layout Anja Bjarnum/Kristian Teilmann Frederiksen 2 Flexicult Vet
Læs mereAnvendelse af Enzymer i Fødevarer
SRP-øvelse ved Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet Anvendelse af Enzymer i Fødevarer Øvelsesvejledning 2013 Henriette Erichsen, Anni Bygvrå Hougaard, Karsten Olsen og Jeanette
Læs mereBiologisk rensning Fjern sukker fra vand
Øvelse B Version 7.0 Biologisk rensning Fjern sukker fra Formål: På renseanlægget renses spildeet mekanisk, biologisk og kemisk. I den biologiske rensning bruges bakterier og mikroorganismer til at nedbryde
Læs mere3y Bioteknologi A. Lærere TK og JM. Eksamensspørgsmål uden bilag
3y Bioteknologi A Lærere TK og JM Eksamensspørgsmål uden bilag 1: DNA, proteiner og gensplejsning Med inddragelse af de vedlagte bilag samt øvelsen med pglo skal du diskutere og vurdere brugen af DNA og
Læs merePortfolio. Fremstilling af den bedste hjemmelavede tykmælk. 1 Hypotesedannelse. Lav jeres hypotese Præsentation af hypotese
Portfolio Fremstilling af den bedste hjemmelavede tykmælk Klik på teksterne herunder, for automatisk at springe til den aktuelle opgave: 1 Hypotesedannelse Lav jeres hypotese Præsentation af hypotese 2
Læs mereLitteratur: Naturfag Niveau D og C, H. Andersen og O. B. Pedersen, Munksgaard, 2016 Grundlæggende kemi intro (kap 2)
Læringsmål Naturfag C niveau Litteratur: Naturfag Niveau D og C, H. Andersen og O. B. Pedersen, Munksgaard, 2016 Grundlæggende kemi intro (kap 2) Du forklarer, hvad et atoms opbygning er ved hjælp af det
Læs mereBiosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning
Opdateret august 2018 Biosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning Vigtig information om brug af Biosensor-kittet for undervisere Før øvelsen startes er det vigtigt, at underviseren har læst følgende erklæring
Læs mereKAN PLASTIK NEDBRYDES?
KAN PLASTIK NEDBRYDES? Øvelsen består af flere dele Lav selv bioplast Design et nedbrydningsforsøg 1. Lav selv bioplast Teori Den plastik, der er i din smartphone, er forskellig fra plasten i din tandbørste
Læs mereELISA Immuno Explorer TM Kit
- 1 - ELISA Immuno Explorer TM Kit Katalog nummer 166-2400EDU Til læreren Dette kit er lavet for at lette og illustrere immunologiundervisningen og kan give en øget forståelse af antigen-antistof interaktionen,
Læs mereEnzymer og katalysatorer
Enzymer og katalysatorer Reaktionsligningen: viser den kemiske reaktion, der leverer energi til alle stofskifteprocesser i cellerne i kroppen. Kemisk er der tale om en forbrændingsproces, hvori atmosfærisk
Læs mereDialyse og carbamidanalyse
C.12.1 Dialyse og carbamidanalyse Formål: Ved dialyse af en vandig opløsning af proteinet albumin og det lavmolekylære stof carbamid trænes forskellige laboratorieprocedurer (afpipettering, tidtagning,
Læs mereDer er bakterier over alt - også i mad!
Der er bakterier over alt - også i mad! en er en del af undervisningsforløbet De skide bakterier Vejledning 1 Podning af bakterier fra jeres omgivelser 2 Mad med bakterier 3 Hjemmelavet yoghurt 4 Er der
Læs mereØvelser 10. KlasseCenter Vesthimmerland Kaj Mikkelsen
Indholdsfortegnelse Indholdsfortegnelse... 1 Bygning af et glucosemolekyle... 2 Bygning af et poly- sakkarid.... 3 Påvisning af glukose (1)... 4 Påvisning af glucose (2)... 5 Påvisning af disakkarider....
Læs mereStudienummer: MeDIS Exam 2015. Husk at opgive studienummer ikke navn og cpr.nr. på alle ark, der skal medtages i bedømmelsen
MeDIS Exam 2015 Titel på kursus: Uddannelse: Semester: Videregående biokemi og medicinudvikling Bachelor i Medis 5. semester Eksamensdato: 26-01-2015 Tid: kl. 09.00-11.00 Bedømmelsesform 7-trin Vigtige
Læs mereFLEXICULT SSI-URINKIT
FLEXICULT SSI-URINKIT Udarbejdet af Niels Frimodt-Møller, Overlæge dr.med. Aase Meyer, Produktspecialist Layout Anja Bjarnum 2 FLEXICULT SSI-URINKIT er et dyrkningskit til diagnosticering af urinvejsinfektioner
Læs mere2UJDQLVNHýVWRIJUXSSHUýLýSODQWHIU
3ODQWHI\VLRORJL,QWURGXNWLRQ 2UJDQLVNHýVWRIJUXSSHUýLýSODQWHIU I et plantefrø findes bl.a. anlægget til en ny plante i form af det såkaldte kimanlæg. Dette anlæg skal kunne udvikle sig til en ny plante under
Læs mereProfessionsbachelorprojekt
A f l æ s n i n g a f r e s i s t e n s b e s t e m m e l s e r f o r u r i n p r ø v e r m e d E s c h e r i c h i a c o l i o g K l e b s i e l l a p n e u m o n i a e e f t e r 6, 9 o g 1 6 t i m e
Læs mereBiotechnology Explorer ELISA Immuno Explorer Kit. Instruktionsmanual
Biotechnology Explorer ELISA Immuno Explorer Kit Instruktionsmanual Katalognummer 166-2400EDU explorer.bio-rad.com Delene i dette kit er sendt i separate æsker. Opbevar posen med reagenser i køleskab indefor
Læs mereDyrk bakterier fra dine omgivelser. Social- og sundhedsuddannelserne. Fagretning - eksempel Pædagogik og sundhed - at arbejde med mennesker
Fagretning - eksempel Pædagogik og sundhed - at arbejde med mennesker Fag Biologi Klassetrin 7. - 9. klasse Varighed 3-4 lektioner Jobmuligheder Social- og sundhedshjælper Social- og sundhedsassistent
Læs mereBilag til Kvantitativ bestemmelse af glucose
Bilag til Kvantitativ bestemmelse af glucose Det synlige formål med øvelsen er at lære, hvorledes man helt præcist kan bestemme små mængder af glucose i en vandig opløsning ved hjælp af målepipetter, spektrofotometer
Læs mereMatematiske modeller Forsøg 1
Matematiske modeller Forsøg 1 At måle absorbansen af forskellige koncentrationer af brilliant blue og derefter lave en standardkurve. 2 ml pipette 50 og 100 ml målekolber Kuvetter Engangspipetter Stamopløsning
Læs mereDet store energikørekort
Blik- og Rørarbejderforbundet - i forbund med fremtiden El- og Vvs-branchens Uddannelsessekretariat - Højnæsvej 71-2610 Rødovre - tlf.: 36 72 64 00 www.vvs-uddannelse.dk/folkeskole - E-mail: folkeskole@vvsu.dk
Læs mereAntibiotikas betydning for hospitalserhvervede infektioner
Antibiotikas betydning for hospitalserhvervede infektioner Kursus i Infektionshygiejne dag 1 30. november 2015 Mona Kjærsgaard Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Antibiotika Eneste lægemiddelgruppe, som IKKE
Læs mereELISA metoden, til bestemmelse af den genetiske profil i høns.
ELISA metoden, til bestemmelse af den genetiske profil i høns. 1 Formål: Formålet med denne øvelse er at demonstrere brugen af antistoffer i diagnostisk eller forskningsøjemed. Dvs. til at undersøge om
Læs mereBIOLOGI A-NIVEAU NY ORDNING. Tirsdag den 19. august 2008. Kl. 09.00 14.00 STX082-BIA STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2008
STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2008 BIOLOGI A-NIVEAU Tirsdag den 19. august 2008 NY ORDNING Kl. 09.00 14.00 Af opgaverne 1, 2, 3 og 4 skal tre og kun tre af opgaverne besvares STX082-BIA Undervisningsministeriet
Læs mereFORSØG ØL verdens første svar på anvendt
FORSØG ØL verdens første svar på anvendt bioteknologi Biotech Academy BioCentrum-DTU Søltofts Plads DTU - Bygning 221 2800 Kgs. Lyngby www.biotechacademy.dk bioteket@biocentrum.dtu.dk INDHOLDSFORTEGNELSE
Læs mereAntibiotikas betydning i forebyggelsen af sygehuserhvervede infektioner. Mona Kjærsgaard Klinisk Mikrobiologisk Afdeling
Antibiotikas betydning i forebyggelsen af sygehuserhvervede infektioner Mona Kjærsgaard Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Antibiotika og bakterier Antibiotika påvirker ikke kun patientens infektion, men
Læs mereProbiotika i akvakultur en strategi til forebyggelse af fiskesygdom
Bettina Spanggaard & Lone Gram Danmarks Fiskeriundersøgelser, Afdeling for Fiskeindustriel Forskning Probiotika i akvakultur en strategi til forebyggelse af fiskesygdom Sygdom hos fisk i opdræt behandles
Læs meremens mange enzymkatalyserede reaktioner er to-substrat reaktioner (2):
KemiF2 Enzymkinetik Trypsin er en serinproteinase, der katalyserer hydrolyse af peptid- og esterbindinger, hvor Arg eller Lys leverer carbonylgruppen. Ved øvelsen bestemmes de kinetiske parameterværdier,
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere:
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Hvilke baser indgår i DNA? A. Adenin, Guanin, Cytosin,
Læs mereAntibiotikas betydning i forebyggelsen af hospitalserhvervede infektioner. Kursus i Infektionshygiejne 28. oktober 2013 Mona Kjærsgaard
Antibiotikas betydning i forebyggelsen af hospitalserhvervede infektioner Kursus i Infektionshygiejne 28. oktober 2013 Mona Kjærsgaard Antibiotika Eneste lægemiddelgruppe, som IKKE har til formål at virke
Læs mereELISA Kvantitativ bestemmelse af human IgA i brystmælk Elevvejledning.
ELISA Kvantitativ bestemmelse af human IgA i brystmælk Elevvejledning. Professionshøjskolen University College Nordjyland Laborantafdelingen 2012 Side 1 Indledning En kvinde føder og bliver mor til sit
Læs mereSelvsamlende enkeltlag elevvejledning
Nano ScienceCenter,KøbenhavnsUniversitet Selvsamlende enkeltlag elevvejledning Fremstilling af enkeltlag på sølv Formål I dette forsøg skal du undersøge, hvordan vand hæfter til en overflade af henholdsvis
Læs mere