cobas EGFR Mutation Test
|
|
- Mathilde Skaarup
- 8 år siden
- Visninger:
Transkript
1 cobas EGFR Mutation Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 Tests P/N: cobas EGFR Mutation Test EGFR 24 Tests P/N: BEMÆRK: Købet af dette produkt giver køberen tilladelse til at anvende det til amplifikation og detektion af nukleinsyresekvenser ved hjælp af PCR (Polymerase Chain Reaction) og relaterede metoder til human in vitrodiagnostik. Der gives ingen generelle patent- eller andre licensrettigheder i forbindelse med købet, bortset fra brugsretten. TILSIGTET BRUG cobas EGFR-mutationstesten er en real-time PCR-test til kvalitativ bestemmelse og identifikation af mutationer i exon 18, 19, 20 og 21 af genet for den epidermale vækstfaktorreceptor (EGFR) i DNA, der stammer fra formalinfikseret paraffinindstøbt (FFPET) humant NSCLC-tumorvæv (ikke-småcellet lungecancer). Testen er beregnet til at blive anvendt til identificering af patienter med fremskreden NSCLC, hvis tumorer har mutationer i exon 18, 19, 20 og 21 af EGFR-genet, og til at udvælge patienter til behandling med small molecule tyrosinkinaseinhibitorer (TKI'er), der angriber EGFR. Prøverne behandles ved hjælp af cobas DNAprøveforberedelseskittet til manuel prøveforberedelse og cobas z 480-analyseinstrumentet til automatisk amplifikation og detektion. OVERSIGT OVER OG FORKLARING AF TESTEN Aktiverende mutationer i genet, der koder for EGFR, forekommer primært ved NSCLC og resulterer i konstitutiv aktivering af EGFRproteinets kinaseaktivitet, hvilket bidrager til den onkogene proces. 1 Forekomsten af disse mutationer i uselekterede tilfælde af NSCLC er cirka 10 %. Disse mutationer forekommer dog oftest, men ikke udelukkende, hos kvindelige patienter, der er ikkerygere/lette rygere af asiatisk herkomst med adenokarcinom histologi. 2 Kliniske data indikerer, at patienter med fremskredne NSCLC-tumorer med aktiverende mutationer af EGFR, hvilket mest forekommer som deletioner i exon 19 eller som L858R-punktmutation i exon 21, udviser en høj responsrate og forlænget progressionsfri overlevelse (PFS) ved behandling med anti-egfr TKI'er, både i første- og andenlinjebehandling. 3-5 Andre mindre kendte EGFR-mutationer, såsom G719X-substitutioner i exon 18 og L861Q-punktmutationen i exon 21 forudsiger også modtagelighed for anti-egfr-behandlinger. 6-8 Medianoverlevelse hos patienter med EGFR-mutant NSCLC behandlet med anti-egfr TKI'er er nu cirka 2 år. 9 Nuværende kliniske retningslinjer anbefaler overvejelse af anti-egfr TKI-behandling som førstelinjebehandling ved fremskreden EGFR-mutant NSCLC. 10,11 De fleste patienter med EGFR-mutant NSCLC udvikler med tiden progressiv sygdom, når de behandles med anti-egfr TKI'er. I cirka halvdelen af disse progressive tilfælde ses sekundære resistensmutationer i EGFR-genet, oftest T790M-mutationen i exon Hos visse patienter kan disse sekundære resistensmutationer detekteres i deres tumorer forud for anti-egfr TKI-behandling. Selv om disse TKI-naive tilfælde stadig viser højt behandlingsrespons, synes disse patienter at have væsentlig kortere PFS (Progression Free Survival) end patienter, hvis tumorer ikke har disse sekundære mutationer. 6,13 PRINCIPPER FOR PROCEDUREN cobas EGFR-mutationstesten er baseret på to hovedprocesser: (1) Manuel prøveforberedelse for at opnå genomisk DNA fra FFPET, og (2) PCR-amplifikation og detektion af target-dna ved hjælp af komplementære primerpar og oligonukleotidprober, der er mærket med fluorescensfarver. Testen er fremstillet til at detektere G719X (G719A, G719C og G719S) i exon 18, deletioner og komplekse mutationer i exon 19, S768I, T790M samt insertioner i exon 20 og L858R i exon 21. Mutationsdetektion opnås gennem PCR-analyse med analyseinstrumentet cobas z 480. En mutant kontrol og negativ kontrol er inkluderet i hver kørsel for at bekræfte validiteten af kørslen. Klargøring af prøver FFPET-prøver behandles, og genomisk DNA isoleres ved hjælp af cobas DNA-prøveforberedelseskittet, en generisk manuel prøveforberedelse, der er baseret på nukleinsyrebinding til glasfibre. Et afparaffineret snit på 5 μm af en FFPET-prøve lyseres ved hjælp af inkubation ved en forhøjet temperatur med en protease og kaotropisk lyserings-/bindingsbuffer, der frigiver nukleinsyrer og beskytter det frigivne genomiske DNA mod DNaser. Efterfølgende tilsættes isopropanol til lysisblandingen, som derefter centrifugeres igennem en kolonne med en glasfiberfilterindsats. Under centrifugeringen bindes det genomiske DNA til glasfiberfilterets overflade. Ubundne stoffer, f.eks. salte, proteiner og andre cellulære urenheder, fjernes ved centrifugering. De adsorberede nukleinsyrer vaskes og elueres derefter med en vandig opløsning. Mængden af genomisk DNA bestemmes spektrofotometrisk og justeres til en fastsat koncentration, der skal tilsættes amplifikations-/detektionsblandingen. Target-DNA'et amplificeres derefter og detekteres på cobas z 480-analyseinstrumentet ved hjælp af amplifikations- og detektionsreagenserne, der følger med cobas EGFR-mutationstestkittet. Afsnittet med oplysninger om dokumentrevision findes sidst i dette dokument DA 1 Doc Rev. 1.0
2 PCR-amplifikation Valg af target cobas EGFR-mutationstestkittet anvender primere, der definerer specifikke baseparsekvenser for hver af de tilsigtede mutationer. For G719X-mutationer i exon 18, er baseparsekvenser i området fra 104 til 106 tilsigtet; for exon 19-deletionsmutationer er baseparsekvenser i området 125 til 141 tilsigtet; for S768I-mutation i exon 20 er en baseparsekvens på 133 tilsigtet; for T790Mmutationen i exon 20 er en baseparsekvens på 118 tilsigtet; for exon 20-insertioner er baseparsekvenser i området fra 125 til 143 tilsigtet, for L858R-mutationen i exon 21 er en baseparsekvens på 138 tilsigtet. Amplifikationen foregår kun i områderne for EGFRgenet mellem primerne. Hele EGFR-genet amplificeres ikke. Amplifikation af target Der anvendes et derivat af Thermus-art Z05-AS1 DNA-polymerase til amplifikation af target. Først opvarmes PCR-reaktionsblandingen for at denaturere det genomiske DNA og blotlægge primerens targetsekvenser. Når blandingen afkøler, bindes upstream- og downstream-primerne til DNA-targetsekvenserne. Z05 DNA-polymerasen forlænger hver bundne primer under tilstedeværelsen af en divalent metalion og overskydende dntp og syntetiserer dermed en anden DNA-streng. Dette afslutter den første cyklus af PCR, der giver en dobbeltstrenget DNA-kopi, som inkluderer de tilsigtede baseparregioner af EGFR-genet. Denne proces gentages et antal gange, hvor mængden af amplikon-dna fordobles for hver cyklus. Automatiseret real-time mutationsdetektion cobas EGFR-mutationstesten anvender real-time PCR-teknologi. Hver target-specifikke oligonukleotide probe i reaktionen mærkes med en fluorescensfarve, som fungerer som rappportfarvestof, og med et quencher-molekyle, der absorberer (dæmper) fluorescensfrigivelsen fra rapportfarvestoffet i en intakt probe. Under hver amplifikationscyklus bindes proben, som er komplementær til den enkeltstrengede DNA-sekvens i amplikonet, og spaltes derefter af 5'-3'-nukleaseaktiviteten i Z05-AS1 DNA-polymerasen. Når rapportfarvestoffet er separeret fra quencher-farvestoffet af denne nukleaseaktivitet, kan fluorescens med en karakteristisk bølgelængde måles, når rapportfarvestoffet exciteres af det korrekte lysspektrum. Der anvendes fire forskellige rapportfarvestoffer til at mærke testens targetmutationer. Amplifikation af de seks EGFR-sekvenser detekteres uafhængigt på tværs af tre reaktioner ved at måle fluorescensen ved de fire karakteristiske bølgelængder i dedikerede optiske kanaler. Selektiv amplifikation Selektiv amplifikation af target-nukleinsyren fra prøven opnås i cobas EGFR-mutationstesten ved hjælp af AmpErase-enzym (uracil-n-glycosylase) og deoxyuridintrifosfat (dutp) 15. AmpErase -enzymet genkender og katalyserer nedbrydningen af DNAstrenge, der indeholder deoxyuridin, men ikke DNA, der indeholder deoxythymidin. Deoxyuridin findes ikke i naturligt forekommende DNA, men findes altid i amplikon som følge af brugen af dutp i stedet for deoxythymidintrifosfat som ét af nukleotidtrifosfaterne i Master Mix-reagenset. Det er derfor kun amplikonet, der indeholder deoxyuridin. Deoxyuridin gør kontaminerende amplikon modtageligt for nedbrydning med AmpErase-enzym, før amplifikationen af target-dna'et. Enzymet AmpErase, der findes i Master Mix-reagenser, katalyserer spaltningen af deoxyuridinholdigt DNA ved deoxyuridin-residues ved at åbne deoxyribosekæden ved positionen C1. Ved opvarmning i den første termiske cyklus ved alkalisk ph brækker amplikonets DNA-kæde ved positionen for deoxyuridin, og dermed kan DNA'et ikke amplificeres. AmpErase-enzymet er inaktivt ved temperaturer over 55 C, dvs. i de termiske cyklusser, og derfor ødelægges target-amplikonet ikke. Det er påvist, at cobas EGFR-mutationstesten kan inaktivere mindst 10 3 kopier af deoxyuridin-holdigt EGFR-mutant amplikon pr. PCR DA 2 Doc Rev. 1.0
3 REAGENSER cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 tests cobas DNA-prøveforberedelseskit (P/N: ) DNA TLB 1 x 10 ml (DNA-vævlysisbuffer) Tris-HCl-buffer Kaliumklorid 0,04 % EDTA 0,1 % triton X-100 0,09 % natriumazid PK 1 x 100 mg (Proteinase K) Proteinase K (frysetørret) Xn Proteinase K Sundhedsskadelig DNA PBB (DNA-paraffinbindingsbuffer) Tris-HCl-buffer 49,6 % guanidinhypoklorid 0,05 % carbamid 17,3 % triton X-100 Xn 49,6 % (w/w) guanidin-hci 1 x 10 ml Sundhedsskadelig WB I (DNA-vaskebuffer I) Tris-HCl-buffer 64 % guanidinhypoklorid Xn 64 % (w/w) guanidin-hci 1 x 25 ml Sundhedsskadelig WB II (DNA-vaskebuffer II) Tris-HCl-buffer Natriumklorid DNA EB (DNA-elueringsbuffer) Tris-HCl-buffer 0,09 % natriumazid FT (filterrør med låg) CT (prøveglas) 1 x 12,5 ml 1 x 6 ml 1 x 25 stk. 3 x 25 stk DA 3 Doc Rev. 1.0
4 cobas EGFR Mutation Test EGFR 24 tests (P/N: ) EGFR 2 x 0,4 ml (EGFR Master Mix 1) Trisbuffer Kaliumklorid Glycerol EDTA Tween 20 3,13 % dimethylsulfoxid 0,09 % natriumazid < 0,10 % dntp'er < 0,01 % Z05 -AS1 DNA-polymerase (mikrobiel) < 0,01 % AmpErase-enzym (uracil-n-glycosylase) (mikrobielt) < 0,01 % aptamer < 0,01 % upstream- og downstream-egfr-primere < 0,01 % fluorescerende EGFR-prober EGFR 2 x 0,4 ml (EGFR Master Mix 2) Trisbuffer Kaliumklorid Glycerol EDTA Tween 20 3,13 % dimethylsulfoxid 0,09 % natriumazid < 0,10 % dntp'er < 0,01 % Z05 -AS1 DNA-polymerase (mikrobiel) < 0,01 % AmpErase-enzym (uracil-n-glycosylase) (mikrobielt) < 0,01 % aptamer < 0,01 % upstream- og downstream-egfr-primere < 0,01 % fluorescerende EGFR-prober EGFR 2 x 0,4 ml (EGFR Master Mix 3) Trisbuffer Kaliumklorid Glycerol EDTA Tween 20 3,13 % dimethylsulfoxid 0,09 % natriumazid < 0,10 % dntp'er < 0,01 % Z05 -AS1 DNA-polymerase (mikrobiel) < 0,01 % AmpErase-enzym (uracil-n-glycosylase) (mikrobielt) < 0,01 % aptamer < 0,01 % upstream- og downstream-egfr-primere < 0,01 % fluorescerende EGFR-prober MGAC 6 x 0,2 ml (Magnesiumacetat) Magnesiumacetat 0,09 % natriumazid EGFR MC 6 x 0,1 ml (EGFR-mutantkontrol) Trisbuffer EDTA Poly-rA RNA (syntetisk) 0,05 % natriumazid < 0,1 % plasmid-dna indeholdende EGFR exonsekvens 18, 19, 20 og 21 (mikrobielt) < 0,1 % EGFR vildtype-dna (cellekultur) DNA SD 2 x 3,5 ml (DNA-prøvediluent) Tris-HCl-buffer 0,09 % natriumazid DA 4 Doc Rev. 1.0
5 ADVARSLER OG FORHOLDSREGLER A. TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. B. Denne test er til brug med FFPET NSCLC-prøver. C. Brug ikke mundpipette. D. Der må ikke spises, drikkes eller ryges i laboratoriets arbejdsområder. E. Undgå mikrobiel og DNA-kontaminering af reagenser. F. Reagenser og affald skal bortskaffes i overensstemmelse med nationale, regionale og lokale bestemmelser. G. Brug ikke kittene efter udløbsdatoen. H. Reagenser fra forskellige lot eller kit må ikke blandes. I. Der skal bæres handsker, og de skal skiftes mellem håndtering af prøver og reagenser for at forhindre kontamination. J. For at undgå kontamination af arbejds-master Mix'et (arbejds-mmx) med DNA-prøver bør amplifikation og detektion foretages i et område, der er adskilt fra DNA-isolering. Arbejdsområdet for amplifikation og detektion bør gøres grundigt rent, før der arbejdes med MMX-forberedelse. For korrekt rengøring bør alle overflader, inklusive racks og pipetter, aftørres grundigt med en opløsning på 0,5 % natriumhypoklorit og derefter med en opløsning på 70 % ethanol. K. DNA PBB og WB I indeholder guanidinhypoklorid. Rengør med egnet laboratorierengøringsmiddel og vand, hvis der spildes væske, som indeholder denne buffer. Hvis der spildes potentielt smittefarlige stoffer, skal det berørte område først rengøres med laboratorierengøringsmiddel og derefter med 0,5 % natriumhypoklorit*. Hvis der spildes på cobas z 480-analyseinstrumentet skal instruktionerne i manualen til cobas z 480-analyseinstrumentet følges. *BEMÆRK: Almindeligt tilgængeligt flydende blegemiddel til husholdningsbrug indeholder typisk natriumhypoklorit med en koncentration på 5,25 %. En 1:10-fortynding af et sådant blegemiddel giver en 0,5 % opløsning af natriumhypoklorit. L. Prøver skal håndteres som smittefarligt materiale i overensstemmelse med forskrifterne for sikkerhed i laboratoriet, f.eks. Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories 16 og i CLSI-dokument M29-A3. 17 M. DNA TLB og DNA PBB indeholder triton X-100, som kan irritere slimhinderne. Undgå kontakt med øjne, hud og slimhinder. N. DNA TLB, DNA EB, MGAC, EGFR, EGFR, EGFR, EGFR MC og DNA SD indeholder natriumazid. Natriumazid kan reagere med bly- og kobberinstallationer og danne højeksplosive metalazider. Når natriumazidholdige opløsninger hældes ud i laboratorievasken, skal afløbet skylles med store mængder koldt vand for at undgå ophobning af azider. O. Xylen er et farligt kemikalie og bør anvendes i et stinkskab. Bortskaf kemisk affald i overensstemmelse med lokale, regionale og nationale bestemmelser. P. Anvend beskyttelsesbriller, særligt arbejdstøj og engangsbeskyttelseshandsker ved håndtering af alle reagenser. Undgå kontakt med huden, øjnene og slimhinderne. Ved kontakt skylles straks med store mængder vand. Der kan opstå ætsninger, hvis området ikke behandles. Hvis der spildes, skal der fortyndes med vand, før det tørres op. Q. Alle engangsartikler må kun bruges én gang. De må ikke genbruges. R. Anvend ikke engangsartikler efter deres udløbsdato. S. Anvend ikke natriumhypokloridopløsning (blegemiddel) til rengøring af cobas z 480-analyseinstrumentet. Rengør cobas z 480 i henhold til de procedurer, der er beskrevet i manualen, der fulgte med cobas z 480-analyseinstrumentet. T. I manualen til cobas z 480-analyseinstrumentet findes der yderligere advarsler, forholdsregler og procedurer til reducering af risikoen for kontaminering af cobas z 480-analyseinstrumentet. U. Det anbefales at bruge sterile engangspipetter og DNase-fri pipettespidser. KRAV TIL OPBEVARING OG HÅNDTERING A. Med undtagelse af PK-reagenset må reagenserne ikke fryses. B. Opbevar DNA TLB, DNA PBB, WB I, WB II, DNA EB, PK, FTog CT ved 15 C til 30 C. Efter åbning kan DNA TLB, DNA PBB, WB I, WB II, DNA EB og PK holde sig op til 8 anvendelser over 90 dage, eller indtil udløbsdatoen, afhængig af hvad der kommer først. C. Efter tilsætning af sterilt, nukleasefrit vand til PK skal ubrugt, rekonstitueret PK opbevares i mængder på 450 μl ved -20 C. Efter rekonstitution skal PK anvendes inden for 90 dage eller indtil udløbsdatoen, afhængig af hvad der kommer først. D. Efter tilsætning af absolut ethanol skal WB I og WB II opbevares ved 15 C til 30 C. Disse arbejdsopløsninger er holdbare i 90 dage eller indtil udløbsdatoen, afhængig af hvad der kommer først. E. Opbevar MGAC, EGFR, EGFR, EGFR, EGFR MC og DNA SD ved 2 C til 8 C. Efter åbning er reagenserne holdbare til 4 anvendelser over 90 dage eller indtil udløbsdatoen, afhængig af hvad der kommer først. F. EGFR, EGFR, EGFR og arbejds-mmx (forberedt ved tilsætning af MGAC til EGFR eller EGFR eller EGFR ) bør beskyttes mod længerevarende udsættelse for lys DA 5 Doc Rev. 1.0
6 G. Arbejds-MMX skal opbevares mørkt ved 2 C til 8 C. De forberedte prøver og kontroller skal tilsættes inden for 1 time efter forberedelsen af arbejds-mmx. H. Behandlede prøver (oprenset DNA) er holdbare i op til 7 dage ved 15 C til 30 C, op til 60 dage ved 2 C til 8 C eller op til 60 dage ved -15 C til -20 C. Behandlede prøver er også holdbare i op til 60 dage ved -15 C til -25 C efter at have gennemgået 3 nedfrysninger/optøninger. I. Amplifikation skal påbegyndes inden for 1 time fra det tidspunkt, de behandlede prøver og kontroller tilsættes arbejds-mmx (forberedt ved tilsætning af MGAC til EGFR eller EGFR eller EGFR ). MEDFØLGENDE MATERIALER A. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 tests cobas DNA-prøveforberedelseskit (P/N: ) DNA TLB (DNA-vævlysisbuffer) PK (Proteinase K) DNA PBB (DNA-paraffinbindingsbuffer) WB I (DNA-vaskebuffer I) WB II (DNA-vaskebuffer II) DNA EB (DNA-elueringsbuffer) FT (filterrør med låg) CT (prøveglas) B. cobas EGFR Mutation Test EGFR 24 tests (P/N: ) MGAC (magnesiumacetat) (låg med gul knap) EGFR (EGFR-Master Mix 1) (låg med hvid knap) EGFR (EGFR-Master Mix 2) (låg med guldfarvet knap) EGFR (EGFR Master Mix 3) (låg med blågrøn knap) EGFR MC (EGFR mutantkontrol) (låg med rød knap) DNA SD (DNA-prøvediluent) DA 6 Doc Rev. 1.0
7 NØDVENDIGE, MEN IKKE MEDFØLGENDE MATERIALER Xylen (Sigma, katalognummer eller Fisher Scientific, katalognummer X5-4 eller tilsvarende) Absolut ethanol (Sigma, katalognummer E7023 eller Fisher Scientific, katalognummer BP eller tilsvarende) Isopropanol (Sigma, katalognummer eller Fisher Scientific, katalognummer A451-1 eller tilsvarende) Sterilt vand, nukleasefrit (Applied Biosystems PCR Grade Water, katalognummer AM9937 eller Thermo Scientific Molecular Biology Grade Water, katalognummer SH eller tilsvarende) Sterile, serologiske engangspipetter: 5 og 25 ml Microwell-plade (AD-plade) og forseglingsfilm (Roche P/N ) til cobas 4800-systemet Hjælpespartel til forseglingsfilm (Roche P/N ) til cobas 4800 Justérbare pipetter* (kapacitet 10 μl, 20 μl, 200 μl og 1000 μl) med aerosolbarriere- eller DNase-fri positive displaceringsspidser Pipette-værktøj (Drummond P/N: eller tilsvarende) Benchtop-mikrocentrifuge med kapacitet til x g og til x g (Eppendorf 5417C eller tilsvarende)** To (2) tørvarmeblokke, der kan varme mikrocentrifugerør op til hhv. 56 C og 90 C** 1,5 ml Safe-Lock-mikrocentrifugerør, der er sterile, RNase/DNase-fri og af PCR-kvalitet (Eppendorf, katalognummer ) Nanodrop UV-Vis-spektrofotometer (Thermo Scientific ND-1000 eller ND-2000)** Vortex-mixer** Mikrocentrifugerør-racks Talkumfrie engangsbeskyttelseshandsker Kalibrerede termometre til tørvarmeblok** Vandbad** der kan opretholde en temperatur på 37 C Enkeltkantet barberblad eller tilsvarende * Pipetter bør vedligeholdes i henhold til producentens anvisninger, og må højst afvige 3 % fra den angivne volumen. Der skal anvendes aerosolbarriere- eller positive DNase-fri displaceringsspidser, hvor det er angivet, for at undgå nedbrydning af prøverne og krydskontaminering. ** Alt udstyr bør vedligeholdes korrekt i henhold til producentens anvisninger Instrumenter og software cobas z 480-analyseinstrumentet cobas 4800 SR2-systemkontrolenhed med OSXP-billede cobas 4800 SR2-systemsoftware, version 2.0 EGFR-analysepakkesoftware, version 1.0 Stregkodelæser, ekstern USB Printer HP P2055d PRØVEINDSAMLING, TRANSPORT OG OPBEVARING BEMÆRK: Alle prøver skal håndteres som potentielt smittefarlige. A. Indsamling af prøver NSCLC FFPET-prøver er blevet valideret til brug med cobas EGFR-mutationstesten. B. Transport af prøver NSCLC FFPET-prøver kan transporteres ved 15 C til 30 C. Transport af FFPET-prøver skal overholde nationale, regionale og lokale bestemmelser for transport af ætiologiske stoffer. 14 C. Opbevaring af prøver NSCLC FFPET-prøver kan opbevares ved 15 C til 30 C i op til 12 måneder efter datoen for vævindsamling. 5 μm-snit, der er anbragt på objektglas, kan opbevares ved 15 C til 30 C i op til 30 dage DA 7 Doc Rev. 1.0
8 BRUGSANVISNING BEMÆRK: Kun NSCLC FFPET-snit med 5 μm tykkelse, der har et tumorindhold på mindst 10 %, kan anvendes i cobas EGFR-mutationstesten. Enhver prøve med et tumorindhold på mindre end 10 % bør makrodissekeres efter afparaffinering. BEMÆRK: Se manualen til cobas z 480-analyseinstrumentet for detaljerede oplysninger om betjening af cobas z 480- analyseinstrumentet. BEMÆRK: Tørvarmeblokke, der kan opvarme mikrocentrifugerør, bør tændes og indstilles til hhv. 56 C og 90 C. Kørselsstørrelse En enkelt kørsel kan inkludere 1 til 30 prøver (plus kontroller) pr. microwell-plade med 96 brønde. Ved kørsel med mere end 24 prøver er det nødvendigt at anvende flere cobas EGFR-mutationstestkit. cobas EGFR-mutationstesten indeholder tilstrækkelige reagenser til 8 kørsler af 3 prøver (plus kontroller) for maksimalt 24 prøver pr. kit. Arbejdsgang Testprocessen med cobas EGFR-mutationstesten består af en manuel prøveforberedelse ved hjælp af cobas DNA-prøveforberedelsekittet efterfulgt af amplifikation/detektion på cobas z 480-analyseinstrumentet med cobas EGFR-mutationstestkittet. Reagensforberedelse A. Rekonstituér proteinase K (PK) ved at tilsætte 4,5 ml sterilt, nukleasefrit vand (PCR-kvalitet) til flasken ved hjælp af en steril, serologisk engangspipette på 5 ml. Bland ved at vende flasken 5 til 10 gange. Afmål 450 μl rekonstitueret PK i 1,5 ml Safe-Lockmikrocentrifugerør, og opbevar ved -20 C. Hvis proteinase K allerede er blevet rekonstitueret og nedfrosset, optøs et passende antal afmålte mængder til behandling af det prøveantal, der skal køres forud for afparaffinering (70 μl rekonstitueret PK er nødvendigt for hver prøve). B. Alle opløsninger, der opbevares ved C, skal være klare. Hvis der er bundfald til stede i et reagens, skal opløsningen opvarmes i et vandbad på 37 C, indtil bundfaldet opløses. Brug ikke opløsningen, før alt bundfaldet er opløst. C. Forbered arbejds-dna-vaskebuffer I (WB I) ved at tilsætte 15 ml absolut ethanol til flasken med WB I. Bland ved at vende flasken 5 til 10 gange. Datér flasken og notér, at der er tilsat ethanol. Opbevar arbejds-wb I ved 15 C til 30 C. D. Forbered arbejds-dna-vaskebuffer II (WB II) ved at tilsætte 50 ml absolut ethanol til flasken med WB II. Bland ved at vende flasken 5 til 10 gange. Datér flasken og notér, at der er tilsat ethanol. Opbevar arbejds-wb II ved 15 C til 30 C. Afparaffinering af FFPET-snit placeret på objektglas BEMÆRK: Xylen er et farligt kemikalie. Alle trin til afparaffinering bør foretages i et stinkskab. Se "Advarsler og forholdsregler". A. Anbring et objektglas, hvorpå der er placeret et 5 μm FFPET-snit, i en beholder med tilstrækkeligt xylen til at dække vævet; lad det stå i blød i 5 minutter. B. Overfør objektglasset til en beholder med tilstrækkeligt absolut ethanol til at dække vævet; lad det stå i blød i 5 minutter. C. Fjern objektglasset fra ethanolen og lad snittet lufttørre (5 til 10 minutter). D. Foretag makrodissektion, hvis prøven har et tumorindhold på mindre end 10 %. E. Markér et 1,5 ml Safe-Lock-mikrocentrifugerør for hver prøve med prøveidentifikationsinformationen. F. Tilsæt 180 μl DNA TLB til 1,5-ml Safe-Lock-mikrocentrifugerøret. G. Tilsæt 70 μl rekonstitueret PK til Safe-Lock-røret indeholdende DNA TLB. H. Skrab vævet af objektglasset og ned i Safe-Lock-røret. Nedsænk vævet i blandingen med DNA TLB/PK. I. Fortsæt med trin A i DNA-isoleringsproceduren. Afparaffinering af FFPET-snit, der ikke er placeret på objektglas BEMÆRK: Xylen er et farligt kemikalie. Alle trin til afparaffinering bør foretages i et stinkskab. Se "Advarsler og forholdsregler". BEMÆRK: Hvis prøven har et tumorindhold på mindre end 10 %, skal snittet placeres på et objektglas til macrodissektion, og proceduren, der er angivet i "Afparaffinering af FFPET-snit placeret på objektglas" skal følges. A. Placér et 5-μm FFPET-snit i et 1,5 ml Safe-Lock-mikrocentrifugerør, der er mærket med prøveidentifikationsinformationen for hver prøve. B. Tilsæt 500 μl xylen til Safe-Lock-røret indeholdende FFPET-snittet. C. Bland på vortex-mixer i 10 sekunder. D. Lad røret stå i 5 minutter ved 15 C til 30 C DA 8 Doc Rev. 1.0
9 E. Tilsæt 500 μl absolut ethanol og bland på vortex-mixer i 10 sekunder. F. Lad røret stå i 5 minutter ved 15 C til 30 C. G. Centrifugér ved x g til x g i 2 minutter. Fjern supernatanten uden at forstyrre pelleten. Bortskaf supernatanten sammen med kemisk affald. H. Tilsæt 1 ml absolut ethanol og bland på vortex-mixer i 10 sekunder. I. Centrifugér ved x g til x g i 2 minutter. Fjern supernatanten uden at forstyrre pelleten. Bortskaf supernatanten sammen med kemisk affald. BEMÆRK: Hvis pelleten flyder i den resterende supernatant, centrifugeres igen i 1 minut ved x g til x g. Fjern eventuel resterende supernatant. J. Tør vævspelleten i 10 minutter ved 56 C i en varmeblok med røret åbent. BEMÆRK: Sørg for, at ethanolen er helt fordampet, og pelleten er tør, før der fortsættes med næste trin. BEMÆRK: Hvis det er nødvendigt, kan tørre pelleter opbevares i op til 24 timer ved 2 C til 8 C. K. Resuspendér vævspelletten i 180 μl DNA-vævlysisbuffer (DNA TLB). L. Tilsæt 70 μl rekonstitueret PK. M. Fortsæt med trin A i DNA-isoleringsproceduren. KLARGØRING AF PRØVER DNA-isoleringsprocedure BEMÆRK: Behandl en negativ kontrol sideløbende med prøven/prøverne. Forbered den negative kontrol ved at blande 180 μl DNA-vævlysisbuffer (DNA TLB) og 70 μl PK-opløsning i et 1,5 ml Safe-Lock-mikrocentrifugerør, der er mærket NEG CT. Den negative kontrol skal behandles ved at følge den samme procedure som den for prøverne. A. Bland rørene, der indeholder prøveblandingen/dna TLB/PK, og den negative kontrolblanding (NEG CT) på vortex-mixeren i 30 sekunder. BEMÆRK: Vævet skal være helt nedsænket i DNA TLB/PK-blandingen. B. Placér rørene i tørvarmeblokken på 56 C, og inkubér i 60 minutter. C. Bland rørene i 10 sekunder på vortex-mixer. BEMÆRK: Vævet skal være helt nedsænket i DNA TLB/PK-blandingen. D. Placér rørene i tørvarmeblokken på 90 C, og inkubér i 60 minutter. BEMÆRK: Under inkuberingen skal det nødvendige antal filterrør (FT'er) med hængslede låg forberedes ved at placere filterrøret på et prøveglas (CT) og mærke hvert filterrørslåg med den rette prøve- eller kontrolidentifikation. BEMÆRK: Hver prøve behøver 1 FT, 3 CT'er og 1 elueringsrør (1,5 ml mikrocentrifugerør). BEMÆRK: Under inkuberingen mærkes det nødvendige antal elueringsrør (1,5 ml mikrocentrifugerør) med den rette prøve- eller kontrolidentifikation. E. Lad rørene køle ned til 15 C til 30 C. Efter afkøling pulscentrifugeres rørene for at opsamle væske fra lågene. F. Tilsæt 200 μl DNA PBB i hvert rør; bland ved at pipettere op og ned 3 gange. G. Inkubér rørene ved 15 C til 30 C i 10 minutter. H. Tilsæt 100 μl isopropanol i hvert rør; bland lysat ved at pipettere op og ned 3 gange. I. Overfør hvert lysat til den relevant mærkede FT-/CT-enhed. J. Centrifugér FT-/CT-enhederne ved x g i 1 minut. K. Placér hvert FT i et nyt CT. Bortskaf udskillelsen fra det gamle CT sammen med kemisk affald, og bortskaf det brugte CT på korrekt vis. L. Tilsæt 500 μl arbejds-wb I i hvert FT. BEMÆRK: Forberedelse af arbejds-wb I er beskrevet i afsnittet "Reagensforberedelse". M. Centrifugér FT-/CT-enhederne ved x g i 1 minut. N. Bortskaf udskillelsen i hver CT sammen med kemisk affald. Sæt FT tilbage i samme CT. O. Tilsæt 500 μl arbejds-wb II i hvert FT. BEMÆRK: Forberedelse af arbejds-wb II er beskrevet i afsnittet "Reagensforberedelse" DA 9 Doc Rev. 1.0
10 P. Centrifugér FT-/CT-enhederne ved x g i 1 minut. Q. Placér hvert FT i et nyt CT. Bortskaf udskillelsen fra det gamle CT sammen med kemisk affald, og bortskaf det brugte CT på korrekt vis. R. Centrifugér FT-/CT-enhederne ved til x g i 1 minut for at tørre filtermembranerne. S. Placér hvert FT i et elueringsrør (1,5 ml mikrocentrifugerør), der er mærket med prøve- eller kontrolidentifikationen. Bortskaf udskillelsen fra det brugte CT sammen med kemisk affald, og bortskaf det brugte CT på korrekt vis. T. Tilsæt 100 μl DNA EB til midten af hver FT-membran, uden at røre FT-membranen. U. Inkubér FT med elueringsrøret ved 15 C til 30 C i 5 minutter. V. Centrifugér FT med elueringsrør ved x g i 1 minut for at opsamle eluat i elueringsrøret. Bortskaf det brugte FT på korrekt vis. W. Luk låget på elueringsrøret. Elueringsrøret indeholder DNA-stock-opløsningen. Fortsæt med trin A i afsnittet DNA-kvantificering. BEMÆRK: Måling af DNA-koncentrationen bør foretages umiddelbart efter DNA-isoleringsproceduren og før opbevaring. DNA-kvantificering: A. Bland hver DNA-stock-opløsning på vortex-mixeren i 5 sekunder. B. Kvantificér DNA ved hjælp af et Nanodrop UV-Vis-spektrofotometer (ND-1000 eller ND-2000) i henhold til producentens anvisninger. Anvend DNA EB som blindprøve for instrumentet. Det er nødvendigt med gennemsnitligt to konsistente aflæsninger. De to målinger skal være inden for ±10 % fra hinanden, når DNA-koncentrationsaflæsningerne er 20,0 ng/μl. For DNA-koncentrationsaflæsninger < 20,0 ng/μl skal de to målinger være inden for ± 2 ng/μl. Hvis de to målinger ikke er inden for ± 10 % fra hinanden, når DNA-koncentrationsaflæsningerne er 20,0 ng/μl, eller inden for ± 2 ng/μl, når DNAkoncentrationsaflæsningerne er < 20,0 ng/μl, skal der foretages yderligere 2 aflæsninger, indtil kravene opfyldes. Gennemsnittet af disse to ny målinger skal derefter beregnes. BEMÆRK: Det er ikke nødvendigt at måle DNA-stock-opløsningen fra den behandlede negative kontrol (NEG CT). C. DNA-stock-opløsningskoncentrationen fra prøverne skal være 2 ng/μl for at kunne foretage cobas EGFR-mutationstesten. Der køres tre amplifikationer/detektioner pr. prøver ved hjælp af 25 μl af en fortynding af DNA-stock-opløsning på 2 ng/μl (i alt 50 ng DNA) for hver amplifikation/detektion. BEMÆRK: Hver DNA-stock-opløsning skal have en minimumkoncentration på 2 ng/μl for at kunne foretage cobas EGFR-mutationstesten. Hvis koncentrationen af DNA-stock-opløsningen er < 2 ng/μl, skal proceduren for afparaffineringen, DNA-isolering og DNA-kvantificering for den pågældende prøve gentages ved hjælp af to 5 μm FFPET-snit. For prøver, der er placeret på objektglas, kombineres vævet fra begge snit i et rør efter afparaffinering, herefter nedsænkes vævet i DNA TLB + PK, og der foretages DNA-isolering og -kvantificering som beskrevet ovenfor. For prøver, der ikke er placeret på objektglas, kombineres to snit i et rør, hvorefter vævet nedsænkes i DNA TLB + PK, og der foretages DNA-isolering og -kvantificering som beskrevet ovenfor. Hvis DNA-stock-opløsning stadig er < 2 ng/μl, skal et nyt FFPET-prøvesnit udbedes fra rekvirenten. BEMÆRK: Opbevar DNA-stock-opløsningen (behandlet prøve og negativ kontrol) ved 2 C - 8 C i op til 2 uger eller ved -20 C i op til 60 dage. AMPLIFIKATION OG DETEKTION BEMÆRK: For at undgå kontamination af arbejds- MMX med DNA-prøver bør amplifikation og detektion foretages i et område, der er adskilt fra DNA-isolering. Arbejdsområdet for amplifikation og detektion bør gøres grundigt rent, før der arbejdes med MMX-forberedelse. For korrekt rengøring bør alle overflader, inklusive racks og pipetter, aftørres grundigt med en opløsning på 0,5 % natriumhypoklorit og derefter med en opløsning på 70 % ethanol. Almindeligt tilgængeligt flydende blegemiddel til husholdningsbrug indeholder typisk natriumhypoklorit med en koncentration på 5,25 %. En 1:10-fortynding af et sådant blegemiddel giver en 0,5 % opløsning af natriumhypoklorit. Opsætning af instrumentet: Se manualen til cobas z 480-analyseinstrumentet for detaljerede instruktioner i opsætning af cobas z 480. Opsætning af testrækkefølge: Se manualen til cobas 4800-systemet, softwareversion 2.0 til cobas EGFR-mutationstest (manual til cobas EGFR) for detaljerede instruktioner vedrørende trinene i EGFR-arbejdsgangen DA 10 Doc Rev. 1.0
11 Fortyndingsberegning af prøve-dna-stock-opløsningen: Fortyndingsberegning til DNA-stock-opløsningskoncentrationer fra 2 ng/μl til 36 ng/μl BEMÆRK: DNA-stock-opløsninger fra prøver bør fortyndes umiddelbart før amplifikation og detektion. BEMÆRK: Der køres tre (3) amplifikationer/detektioner for hver prøve, hvilket kræver en samlet volumen på 75 μl (25 μl for hver af tre reaktioner) for en fortynding af DNA-stock-opløsning på 2 ng/μl (af i alt 150 ng DNA). A. Beregn den nødvendige volumen (μl) af DNA-stock-opløsning, der er nødvendig til hver prøve: μl af DNA-stock-opløsning = (90 μl x 2 ng/μl) DNA-stock-opløsningskoncentration [ng/μl] B. For hver prøve beregnes den nødvendige volumen (μl) af DNA-prøvefortynder (DNA SD): μl af DNA SD = 90 μl μl af DNA-stock-opløsning Eksempel: DNA-stock-opløsningskoncentration = 6,5 ng/μl A. μl af DNA-stock-opløsning = (90 μl x 2 ng/μl) 6,5 ng/μl = 27,7 μl B. μl af DNA SD = (90 μl 27,7 μl) = 62,3 μl Fortyndingsberegning til DNA-stock-opløsningskoncentrationer > 36 ng/μl BEMÆRK: DNA-stock-opløsninger fra prøver bør fortyndes umiddelbart før amplifikation og detektion. BEMÆRK: Der køres tre (3) amplifikationer/detektioner for hver prøve, hvilket kræver en samlet volumen på 75 μl (25 μl for hver af tre reaktioner) for en fortynding af DNA-stock-opløsningen på 2 ng/μl (af i alt 150 ng DNA). A. Ved DNA-stock-opløsningskoncentrationer > 36 ng/μl anvendes følgende formel til at beregne mængden af DNAprøvefortynder (DNA SD), der er nødvendig til at forberede mindst 90 μl fortyndet DNA-stock-opløsning. Dette er for at sikre, at hver prøve anvender minimum 5 μl DNA-stock-opløsning. B. For hver prøve beregnes den volumen (μl) af DNA SD, der er nødvendig for at fortynde 5 μl DNA-stock-opløsning til 2 ng/μl: Nødvendig volumen af DNA SD i μl = ((5 μl DNA-stock-opløsning x DNA-stock-opløsningskoncentration i ng/μl) / 2 ng/μl) 5 μl Eksempel: Koncentration af DNA-stock-opløsning = 100 ng/μl A. Nødvendig volumen af DNA SD i μl = ((5 μl x 100 ng/μl) / 2 ng/μl) 5 μl = 245 μl B. Anvend den beregnede volumen af DNA SD til at fortynde 5 μl DNA-stock-opløsning. Prøvefortynding A. Forbered det relevante antal 1,5 ml Safe-Lock-mikrocentrifugerør til DNA-fortyndinger ved at mærke dem med den rette prøveidentifikation. B. Tilsæt ved hjælp af en pipette med en ny aerosolresistent spids den beregnede volumen af DNA SD i rørene, der er mærket hertil. Pipettér 45 μl DNA SD i et Safe-Lock-rør, der er mærket som NEG CT. C. Bland hver DNA-stock-opløsning og den negative kontrol i en vortex-mixer i 5 til 10 sekunder. D. Tilsæt ved hjælp af en pipette med en aerosolresistent pipettespids (en ny spids til hver pipettering) forsigtigt den beregnede volumen af hver DNA-stock-opløsning i det pågældende rør, der indeholder DNA SD. Pipettér 45 μl negativ kontrol (oprenset eluat) i NEG CT-røret. E. Sæt låg på rørene, og bland hvert rør i 5 til 10 sekunder på vortex-mixer. F. Skift handsker DA 11 Doc Rev. 1.0
12 Forberedelse af arbejdsblandingerne (, og ) BEMÆRK: EGFR, EGFR, EGFR og arbejds-mmx er lysfølsomme og skal beskyttes mod længerevarende udsættelse for lys. BEMÆRK: På grund af viskositeten i EGFR-BLANDINGERNE og arbejds-mmx, skal man pipettere langsomt for at sikre, at blandingen er helt afpipetteret fra spidsen. BEMÆRK: EGFR, EGFR og EGFR kan forekomme lysblå/lillaagtig. Dette påvirker ikke reagensets performance. Forbered tre arbejds-mmx, én indeholdende EGFR, én indeholdende EGFR og den sidste indeholdende EGFR i separate 1,5 ml Safe-Lock-mikrocentrifugerør. A. Beregn volumenen af EGFR eller EGFR eller EGFR, der er nødvendigt for hver arbejds-mmx, ved hjælp af følgende formel: Nødvendig volumen af EGFR eller EGFR eller EGFR = (antal prøver + 2 kontroller +1) x 20 μl B. Beregn den nødvendige volumen af MGAC til hver arbejds-mmx ved hjælp af følgende formel: Nødvendig volumen af MGAC = (antal prøver + 2 kontroller +1) x 5 μl Brug tabel 1 til at bestemme volumenen for hver reagens, der er nødvendig til forberedelse af arbejds-mmx, baseret på antallet af prøver i kørslen. Tabel 1 Nødvendige volumener af reagenser til arbejds-, arbejds- og arbejds- Antal prøver* MMX 20 μl MGAC 5 μl Samlet volumen for hver arbejds-mmx (μl) * Volumener for antallet af prøver er baseret på summen af antallet af prøver + 2 kontroller + 1 C. Fjern det relevante antal EGFR -, EGFR -, EGFR - og MGAC-flasker fra opbevaringen ved 2 C til 8 C. Bland hver reagens i 5 sekunder, og indsaml væsken i bunden af røret før brug. Mærk et sterilt mikrocentrifugerør til arbejds-, arbejds- og arbejds-. D. Tilsæt den beregnede volumen af EGFR eller EGFR eller EGFR til de pågældende arbejds-mmx-rør. E. Tilsæt den beregnede volumen af MGAC til arbejds-mmx-rørene. F. Bland rørene på vortex-mixer 3-5 sekunder for at sikre korrekt blanding. BEMÆRK: Prøver og kontroller bør tilsættes microwell-pladen (AD-plade) inden for 1 time efter forberedelsen af arbejds-mmx'er. BEMÆRK: Brug kun microwell-plade (AD-plade) og forseglingsfilm (Roche P/N ) til cobas systemet DA 12 Doc Rev. 1.0
13 Forberedelse af plade Figur 1 Prøvepladelayout Figur 1. Pladelayout for cobas EGFR-mutationstesten Række/ kolonne A B C D E F G H MUT NEG S1 S2 S3 S4 S5 S6 MUT NEG S1 S2 S3 S4 S5 S6 MUT NEG S1 S2 S3 S4 S5 S6 S7 S8 S9 S10 S11 S12 S13 S14 S7 S8 S9 S10 S11 S12 S13 S14 S7 S8 S9 S10 S11 S12 S13 S14 S15 S16 S17 S18 S19 S20 S21 S22 S15 S16 S17 S18 S19 S20 S21 S22 S15 S16 S17 S18 S19 S20 S21 S22 S23 S24 S25 S26 S27 S28 S29 S30 S23 S24 S25 S26 S27 S28 S29 S30 S23 S24 S25 S26 S27 S28 S29 S30 Hvor: NEG = negativ kontrol, MUT = mutant kontrol, S# = prøve-id og MMX-# svarer til Master Mix-reagens 1, 2 eller 3. BEMÆRK: Alle prøver skal spredes over tre konsekutive kolonner i en række for at kunne frembringe et resultat. A. Pipettér 25 μl arbejds-mmx i hver reaktionsbrønd på microwell-pladen (AD-plade), som er nødvendig til kørslen. Lad ikke pipettespidsen røre pladen uden for brønden. Tilsæt arbejds- (indeholdende EGFR ) til microwell-pladebrøndene (AD-plade) i række 1, 4, 7 og 10 efter behov. Tilsæt arbejds- (indeholdende EGFR ) til microwell-pladebrøndene (AD-plade) i kolonne 2, 5, 8 og 11 efter behov. Tilsæt arbejds- (indeholdende EGFR ) til microwell-pladebrøndene (AD-plade) i kolonne 3, 6, 9 og 12 efter behov. B. Pipettér 25 μl af EGFR MC i brønd A1, A2 og A3 på microwell-pladen (AD-plade); bland grundigt ved at bruge pipetten til at aspirere og dispensere i brønden minimum to gange. C. Pipettér 25 μl af NEG CT i brønd B1, B2 og B3 på microwell-pladen (AD-plade) ved brug af en ny pipettespids; bland grundigt ved at bruge pipetten til at aspirere og dispensere i brønden minimum to gange. BEMÆRK: Hver kørsel skal indeholde positiv kontrol (EGFR MC) i brønd A1, A2 og A3, og negativ kontrol (NEG CT) i brønd B1, B2 og B3. I modsat fald ugyldiggøres kørslen af cobas z 480-analyseinstrumentet. BEMÆRK: Skift handsker efter behov for at beskytte mod prøve-til-prøve-kontamination og kontamination af ydersiden af PCR-reaktionsrør. D. Brug en ny pipettespids til hver fortyndet DNA-prøve, og tilsæt 25 μl af den første DNA-prøve til brønd C1, C2 og C3 på microwell-pladen (AD-plade) idet der bruges en ny spids ved tilsætning af DNA-prøven til hver af brøndene. Bland hver brønd ved at bruge pipetten til at aspirere og dispensere i brønden minimum to gange. Gentag denne procedure for det fortyndede DNA fra den anden prøve (brønd D1, D2 og D3). Følg templaten i figur 1, indtil alle prøvernes DNA-fortyndinger er pipetteret til microwell-pladen (AD-plade). Sørg for, at al væske er samlet i bunden af brøndene. E. Tildæk microwell-pladen (AD-plade) med forseglingsfilm (leveres sammen med pladerne). Brug hjælpespartlen til forseglingsfilm til at forsegle microwell-pladen (AD-plade). F. Kontrollér, at al væske er samlet i bunden af hver brønd, før PCR startes. BEMÆRK: Amplifikation og detektion bør startes inden for 1 time efter tilsætning af den første prøve DNA-fortynding til arbejds-mmx. Start af PCR Se manualen til cobas EGFR for detaljerede instruktioner vedrørende trinene i EGFR-arbejdsgangen DA 13 Doc Rev. 1.0
14 FORTOLKNING AF RESULTATER BEMÆRK: Al validering af kørsler og prøver udføres af cobas 4800-softwaren. BEMÆRK: En gyldig testkørsel kan indeholde både gyldige og ugyldige prøveresultater. Hvis kørslen er gyldig, skal prøveresultaterne fortolkes som vist i tabel 2. Tabel 2 Fortolkning af resultater fra cobas EGFR-mutationstest Testresultat Mutationsresultat Fortolkning Mutation Detected Exon 19-deletion S768I L858R T790M G719X (G719A, G719C, G719S) Exon 20-insertion (der kan være mere end én mutation til stede) Mutation detekteret i specificeret target-egfr-område. Mutation Not Ikke tilgængelig Mutation ikke detekteret i target-egfr-områder Detected* Invalid Ikke tilgængelig Prøveresultatet er ugyldigt. Gentag testen af prøver med ugyldige resultater ved at følge instruktionerne, der er beskrevet i afsnittet Gentagelse af test af prøver med ugyldige resultater nedenfor. Failed Ikke tilgængelig Kørsel mislykket på grund af hardware- eller softwarefejl. Kontakt dit lokale Roche-kontor for teknisk hjælp. * Resultatet "Mutation Not Detected" (Mutation ikke detekteret) udelukker ikke tilstedeværelsen af en mutation i target-egfrområderne, da resultater afhænger af procenten af mutante sekvenser, korrekt prøveintegritet, fravær af inhibitorer og tilstrækkelig DNA, før der kan foretages en detektion. Gentagelse af test af prøver med ugyldige resultater A. Gentag fortynding af den ugyldige prøve-dna-stock-opløsning fra procedurerne Fortyndingsberegning af prøve-dnastock-opløsningen og Prøvefortynding i afsnittet AMPLIFIKATION OG DETEKTION. B. Efter at have foretaget DNA-stock-opløsningsfortynding til 2 ng/μl som beskrevet i Prøvefortynding fortsættes med Forberedelse af arbejdsblandingerne (, og ) og resten af amplifikations- og detektionsproceduren. BEMÆRK: Hvis prøven forbliver ugyldig efter at have foretaget testen igen, eller hvis der ikke var tilstrækkelig DNAstock-opløsning til at forberede en anden opløsning i Gentagelse af test af prøver med ugyldige resultater, trin A, skal hele testproceduren gentages for den pågældende prøve ved at starte med afsnittet Afparaffinering og DNA-isolering ved hjælp af et nyt 5-μm FFPET-snit. KVALITETSKONTROL Der skal inkluderes et kit af cobas EGFR-testmutantkontrol (EGFR MC) og negativ kontrol (NEG CT) til arbejds-, arbejds- og arbejds- i hver kørsel på op til 30 prøver. En kørsel er gyldig, hvis EGFR-mutantkontrolbrøndene (EGFR MC) (A1, A2 og A3) og de negative kontrolbrønde (NEG CT) (B1, B2 og B3) er gyldige. Hvis EGFR-mutantkontrollen (EGFR MC) eller den negative kontrol (NEG CT) for arbejds- eller arbejds- eller arbejds- er ugyldige, er hele kørslen ugyldig og skal gentages. Forbered en frisk fortynding af den tidligere isolerede prøve af DNA-stock-opløsning for at opsætte en ny microwellplade (AD-plade) med kontrol til amplifikation og detektion. Positiv kontrol Resultatet for EGFR-mutantkontrol (EGFR MC) skal være "Valid" (gyldigt) for arbejds-, arbejds- og arbejds-. Hvis EGFR MC-resultaterne konstant er ugyldige, kontaktes Roche for teknisk hjælp. Negativ kontrol Resultatet for negativ kontrol (NEG CT) skal være "Valid" (gyldigt) for arbejds-, arbejds- og arbejds-. Hvis NEG CT-resultaterne konstant er ugyldige, kontaktes dit lokale Roche-kontor for teknisk hjælp DA 14 Doc Rev. 1.0
15 FORHOLDSREGLER VED PROCEDURERNE Som ved alle testprocedurer er det vigtigt med god laboratorieteknik for en korrekt performance af analysen. På grund af testens høje analytiske sensitivitet skal man være omhyggelig med at undgå, at reagenser og amplifikationsblandinger kontamineres. BEGRÆNSNINGER VED PROCEDURERNE 1. Test kun de angivne prøvetyper. cobas EGFR-mutationstesten er kun blevet valideret til brug med NSCLC FFPET-prøver. 2. cobas EGFR-mutationstesten er kun blevet valideret ved hjælp af cobas DNA-prøveforberedelseskittet (Roche P/N: ). 3. Detektionen af en mutation er afhængig af det antal kopier, der findes i prøven, og kan påvirkes af prøveintegriteten, mængden af isoleret DNA og tilstedeværelsen af interfererende stoffer. 4. Pålidelige resultater er afhængige af korrekte procedurer for prøvefiksering, transport, opbevaring og behandling. Følg procedurerne i dette pakningsindlæg og i manualen til cobas EGFR. 5. Effekten fra andre potentielle variabler, såsom prøvefikseringsvariabler, er ikke blevet evalueret. 6. Tilsætningen af AmpErase-enzym til cobas EGFR-mutationstestens Master Mix aktiverer den selektive amplifikation af target- DNA. Kontaminering fra reagenser kan dog kun undgås med god laboratoriepraksis og nøje overholdelse af de procedurer, der er angivet i dette pakningsindlæg. 7. Dette produkt må kun anvendes af medarbejdere, som er uddannet i brugen af PCR-teknikker og brugen af cobas systemet. 8. Kun cobas z 480-analyseinstrumentet er blevet valideret til brug med dette produkt. Der kan ikke anvendes nogen anden thermocycler med real-time optisk detektion med dette produkt. 9. På grund af naturlige forskelle mellem teknologier anbefales det, at brugeren udfører metodekorrelationsundersøgelser i laboratoriet for at fastslå teknologiske forskelle, før der skiftes fra en teknologi til en anden. 10. Selvom de er sjældne, kan mutationer inden for regionerne af de genomiske DNA i EGFR-genet, som er dækket af cobas EGFR-mutationstestens primere og/eller prober, medføre, at tilstedeværelsen af en mutation ikke detekteres. 11. Forekomst af PCR-hæmmere kan medføre falsk-negative eller ugyldige resultater. 12. Selvom det er sjældent, viser cobas EGFR-mutationstesten resultatet "Mutation Not Detected" for visse mutationer og begrænset krydsreaktivitet (resultater af "Mutation Detected") for mutationer, der ligger ved siden af targetmutationer i exon 18, 19, 20 og cobas EGFR-mutationstesten er valideret til brug med 50 ng DNA per reaktionsbrønd. DNA-inputmængder mindre end 50 ng per reaktionsbrønd anbefales ikke. EVALUERING AF IKKE-KLINISK PERFORMANCE Analytisk sensitivitet Analytisk sensitivitet for cobas EGFR-mutationstest ved hjælp af plasmidblandinger Seks DNA-plasmidkonstruktioner, der indeholder den hyppigst observerede mutation for hver mutationsklasse detekteret af testen, blev blandet med vildtype cellelinje-dna til en endelig targetsammensætning på 5 % mutantsekvens baseret på tilsvarende genomisk DNA. Serielle fortyndinger af de 5 % mutantsekvensstamopløsninger blev forberedt, og 24 bestemmelser af hvert panelmedlem blevet testet ved hjælp af 3 kit med forskellige lotnumre af cobas EGFR-mutationstesten. Analytisk sensitivitet blev fastlagt ved den laveste mængde DNA, der gav et EGFR-niveau for "Mutation Detected" (Mutation detekteret) på mindst 95 % for targetmutationen, som det fremgår af tabel 3. Tabel 3 Sensitivitet for cobas EGFR-mutationstest ved anvendelse af DNA fra plasmid- og cellelinjeblandinger EGFR exon EGFR-mutation Targetnukleinsyresekvens Mindste mængde DNA (ng) i 5 % muteret panelmedlem per reaktionsbrønd til at opnå et niveau på 95 % af "Mutation Detected" (N=72 bestemmelser) 18 G719A 2156 G>C 3,13 19 Exon 19-deletion del15 0,78 20 S768I 2303 G>T 0,78 20 T790M 2369 C>T 3,13 20 Exon 20-insertion 2307_2308ins9 (GCCAGCGTG) 3,13 21 L858R 2573 T>G 0, DA 15 Doc Rev. 1.0
16 Analytisk sensitivitet ved brug af FFPET-prøveblandinger Tre FFPET-prøver af oprenset DNA for Exon 19-deletion og L858R-mutationer blev blandet med EGFR vildtype FFPET-prøveekstrakter til opnåelse af blandinger med prøver med et targetmutationsniveau på 10, 5,0, 2,5 og 1,25 %, som bestemt med en valideret, hyperparallel sekventeringsmetode, 454-sekventering (454 Life Sciences, Branford, CT, USA). Serielle fortyndinger af hver af prøveblandingerne blev forberedt, og der blev kørt otte (8) bestemmelser for hvert panelmedlem ved hjælp af 3 kit med forskellige lotnumre af cobas EGFR-mutationstest (n=24/panelmedlem). Sensitiviteten for hver prøve blev bestemt ved den laveste mængde DNA, der gav et EGFR-niveau for "Mutation Detected" på mindst 95 % for targetmutationen, vist i tabel 4. Tabel 4 Sensitivitet for cobas EGFR-mutationstest ved hjælp af FFPET-prøveblandinger EGFRmutation Prøve EGFR-nukleinsyresekvens Exon 19- deletion L858R Prøve nr _2249del15 1,4 Prøve nr _2250del15 2,5 Prøve nr _2252del15 2,4 Prøve nr T>G 4,0 Prøve nr T>G 4,2 Prøve nr T>G 4,3 Procent mutation i panelmedlem til opnåelse af et niveau på 95 % "Mutation Detected" med 50 ng DNA-input per reaktionsbrønd (N=24 bestemmelser) Dette forsøg viser, at cobas EGFR-mutationstesten kan detektere mutationer i EGFR exon 19 og 21 med et mutationsniveau på mindst 5 % ved hjælp af et standard input på 50 ng per reaktionsbrønd. Korrelation til referencemetode Sammenligningstest af 201 FFPET NSCLC-prøver ved hjælp af hver af 2 lot cobas EGFR-mutationstest og 2X bidirektionel sekventering (Sanger) blev udført for at bestemme den positive, negative og samlede procentvise overensstemmelse mellem metoderne. Afvigende resultater mellem cobas EGFR-mutationstesten og Sanger blev testet ved hjælp af 454-sekventering for at løse uoverensstemmelserne. Prøver, der gav ugyldige resultater med cobas EGFR-mutationstesten og/eller Sanger, blev udelukket fra analyse. Resultaterne for cobas EGFR-mutationstesten betragtes som ugyldige, hvis et eller flere mutations-calls rapporteres som "invalid" (tabel 2). Sanger-resultater betragtes som ugyldige, hvis et eller flere af de fire exons for en prøve ikke kan give gyldige resultater. cobas EGFR-mutationstest og Sanger-resultater Ud af de 201 prøver, der blev evalueret i sammenligningen, kunne 49 ikke evalueres for overensstemmelse, fordi den ene eller begge metoder gav ugyldige resultater. 48 prøver var ugyldige for Sanger (23,8 %), 6 prøver var ugyldige for cobas EGFR-mutationstest lot 1 (3,0 %) og 5 prøver var ugyldige for cobas EGFR-mutationstest lot 2 (2,5 %). Fordelingen af de ugyldige resultater for hver af metoderne kan ses i tabel 5. Tabel 5 Fordeling af ugyldige resultater for de forskellige metoder cobas EGFR-mutationstest Ugyldige prøver efter metode Lot 1 Lot 2 Kun ugyldig ved Sanger Kun ugyldig ved cobas 1 1 Ugyldige ved Sanger og cobas 5 4 I alt DA 16 Doc Rev. 1.0
17 Sammenligningen af de 152 gyldige resultater for Sanger og cobas EGFR-mutationstesten vises i tabel 6. Tabel 6 Overensstemmelsesanalyse for cobas EGFR-mutationstest (per lot) vs. Sanger cobas Lot 1 Sanger Sanger MD MND I alt MD MND I alt MD MD cobas MND Lot 2 MND I alt I alt Positiv overensstemmelse = 95,8 % (95 % CI = 88,3 til 99,1 %) Positiv overensstemmelse = 95,8 % (95 % CI = 88,3 til 99,1 %) Negativ overensstemmelse = 97,5 % (95 % CI = 91,3 til 99,7 %) Negativ overensstemmelse = 97,5 % (95 % CI = 91,3 til 99,7 %) Samlet overensstemmelse = 96,7 % (95 % CI = 92,5 til 98,9 %) Samlet overensstemmelse = 96,7 % (95 % CI = 92,5 til 98,9 %) MD: Mutation detekteret MND: Mutation ikke detekteret Sammenfaldet mellem cobas EGFR-mutationstesten vs. Sanger var 96,7 % (i alt 5 afvigende resultater) for lot 1 og 96,7 % (i alt 5 afvigende resultater) for lot 2. Sammenligningen mellem cobas EGFR-mutationstesten og Sanger evaluerede seks targets for hver prøve. Der blev udført i alt 912 calls baseret på resultaterne fra de 152 gyldige prøver. Tabel 7 og tabel 8 viser sammenligningen mellem cobas EGFRmutationstesten og Sanger på en per call-basis henholdsvis for lot 1 og lot 2. To gyldige prøver var afvigende mellem lot 1 og lot 2 i cobas EGFR-mutationstesten: Én prøve havde et Exon 20-insertion-call for lot 1 og et MND-call for lot 2. Den anden prøve havde et Exon 19-deletion-call for lot 2 og et MND-call for lot 1. Tabel 7 Sammenligning per call af cobas EGFR-mutationstest (Lot 1) vs. Sanger cobas Lot 1 Sanger G719X Ex 19 Del S768I Ex 20 Ins T790M L858R MND Andet I alt G719X Ex 19 Del S768I Ex 20 Ins T790M L858R MND * 837 I alt * Sanger-resultatet for én prøve var G719D, en mutation som cobas EGFR-mutationstesten ikke retter sig mod. Med henblik på analysen blev denne prøve kategoriseret som MND for begge metoder DA 17 Doc Rev. 1.0
18 Tabel 8 Sammenligning per call af cobas EGFR-mutationstest (Lot 2) vs. Sanger Sanger G719X Ex 19 Del S768I Ex 20 Ins T790M L858R MND Andet I alt G719X Ex 19 Del S768I cobas Ex 20 Ins Lot 2 T790M L858R MND * 837 I alt * Sanger-resultatet for én prøve var G719D, en mutation som cobas EGFR-mutationstesten ikke retter sig mod. Med henblik på analysen blev denne prøve kategoriseret som MND for begge metoder. Analyse af afvigende resultater med 454-sekventering Baseret på sammenligningsresultaterne i forhold til Sanger var 5 prøver gyldige og afvigende for hvert lot af cobas EGFRmutationstesten. Prøver, der gav afvigende resultater mellem cobas EGFR-mutationstesten og Sanger, blev analyseret med 454- sekventering og vises i tabel 9. En revideret overensstemmelsesanalyse blev udført baseret på 454-sekventeringsresultaterne. I denne analyse blev prøver med 454-sekventeringsresultater, der var i overensstemmelse med cobas EGFR-mutationstestens resultater, betragtet som overensstemmende. Prøver med 454-sekventeringsresultater, der var i overensstemmelse med Sanger, blev betragtet som afvigende. Tabel 9 Løsning af afvigende prøver med 454-sekventering Prøve Sanger cobas Lot 1 cobas Lot bestemmelse Prøve 1 G719A MND MND MND Prøve 2* G719S MND MND G719S (1,1 % mutation) Prøve 3 Ex 19 Del MND MND MND Prøve 4** MND MND Ex 19 Del Ex 19 Del (3,0 % mutation) Prøve 5 MND Ex 20 Ins Ex 20 Ins Ex 20 Ins (12,9 % mutation) Prøve 6 MND Ex 20 Ins MND MND * Prøve 2 blev bekræftet som G719S med 454-sekventering med 1,1 % mutation. Dette er under detektionsgrænsen for cobas EGFRmutationstesten. **Prøve 4 blev bekræftet som Exon 19-deletion med 454-sekventering med 3,0 % mutation. Dette er ved eller tæt på detektionsgrænsen for cobas EGFR-mutationstesten. Efter løsning af de prøver, der var afvigende i cobas EGFR-mutationstesten vs. Sanger, med 454-sekventering, var den samlede overensstemmelse på tværs af alle mutationsklasser, som analysen er rettet mod, 98,7 % for lot 1 og 99,3 % for lot 2 af cobas EGFRmutationstesten som vist i tabel 10. Tabel 10 Overensstemmelsesanalyse af cobas EGFR-mutationstesten (per lot) vs. Sanger med løsning af afvigende resultater med 454-sekventering cobas Lot 1 Sanger, løst ved hjælp af 454-sekventering Sanger, løst ved hjælp af 454-sekventering MD MND I alt MD MND I alt MD MD MND cobas Lot 2 MND I alt I alt Positiv overensstemmelse = 98,6 % (95 % CI = 92,4 til 100 %) Positiv overensstemmelse = 98,6 % (95 % CI = 92,5 til 100 %) Negativ overensstemmelse = 98,8 % (95 % CI = 99,3 til 100 %) Negativ overensstemmelse = 100 % (95 % CI = 96,3 til 100 %) Samlet overensstemmelse = 98,7 % (95 % CI = 95,3 til 99,8 %) Samlet overensstemmelse = 99,3 % (95 % CI = 96,4 til 100 %) DA 18 Doc Rev. 1.0
19 Tabel 11 og 12 viser sammenligningen af cobas EGFR-mutationstesten og Sanger med løsning af afvigende resultater med 454- sekventering på en per call-basis for henholdsvis lot 1 og lot 2. Tabel 11 Sammenligning per call af cobas EGFR-mutationstest (Lot 1) vs. Sanger med løsning af afvigende resultater med 454-sekventering cobas Lot 1 Sanger, løst ved hjælp af 454-sekventering G719X Ex 19 Del S768I Ex 20 Ins T790M L858R MND Andet I alt G719X Ex 19 Del S768I Ex 20 Ins T790M L858R MND * 837 I alt * Sanger-resultatet for én prøve var G719D, en mutation som cobas EGFR-mutationstesten ikke retter sig mod. Med henblik på analysen blev denne prøve kategoriseret som MND for begge metoder. Tabel 12 Sammenligning per call af cobas EGFR-mutationstest (Lot 2) vs. Sanger med løsning af afvigende resultater med 454-sekventering cobas Lot 2 Sanger, løst ved hjælp af 454-sekventering G719X Ex 19 Del S768I Ex 20 Ins T790M L858R MND Andet I alt G719X Ex 19 Del S768I Ex 20 Ins T790M L858R MND * 837 I alt * Sanger-resultatet for én prøve var G719D, en mutation som cobas EGFR-mutationstesten ikke retter sig mod. Med henblik på analysen blev denne prøve kategoriseret som MND for begge metoder DA 19 Doc Rev. 1.0
20 Inklusivitet med plasmider cobas EGFR-mutationstesten har vist sig at kunne detektere de mutationer, der ses i tabel 13. Tabel 13 Mutationer, der detekteres af cobas EGFR-mutationstesten Exon 18 mutations-call G719X Mutation Aminosyreændring COSMIC ID 2155 G>A G719S G>T G719C G>C G719A 6239 Exon 19 mutations-call Exon 19-deletion Mutation Aminosyreændring COSMIC ID 2235_2249del15 E746_A750del _2250del15 E746_A750del _2257del18 L747_P753>S _2254del15 L747_T751del _2256del18 L747_S752del _2251>C L747_T751>P _2251del15 E746_T751>A _2255>T E746_S752>V _2248TTAAGAGAAG>C E747_A750>P _2253del15 L747_T751del _2247del9 L747_E749del _2252>AAT E746_T751>I _2253del18 E746_T751del _2254del18 E746_S752>A _2255del18 E746_S752>D _2248>GC L747_A750>P _2252>GCA L747_T751>Q _2258>CA L747_P753>Q _2251del12 L747_T751>S _2247del15 K745_E749del _2276del24 S752_I759del _2248>AATTC E746_A750>IP _2252>T E746_T751>V _2251>AATTC E746_T751>IP _2255>AAT E746_S752>I _2253>TTGCT E746_T751>VA _2257>TCT E746_P753>VS _2252del15 L747_T751del _2256>CAA L747_S752>Q DA 20 Doc Rev. 1.0
cobas KRAS Mutation Test KRAS
cobas KRAS Mutation Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 Tests P/N: 05985536190 cobas KRAS Mutation Test KRAS 24 Tests P/N: 05852170190 BEMÆRK: Købet af dette produkt
Læs merecobas KRAS Mutation Test
cobas KRAS Mutation Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 Tests P/N: 05985536190 cobas KRAS Mutation Test KRAS 24 Tests P/N: 05852170190 BEMÆRK: Købet af dette produkt
Læs merecobas 4800 HPV Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK.
cobas 4800 HPV Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. BRUGERE MED SYSTEMSOFTWAREVERSION 1.1.2 SKAL FØLGE INSTRUKTIONERNE I AFSNIT A. BRUGERE MED SYSTEMSOFTWAREVERSION 2.1 ELLER NYERE SKAL FØLGE INSTRUKTIONERNE
Læs merecobas 4800 HPV Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK.
cobas 4800 HPV Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas 4800 System Sample Preparation Kit c4800 SMPL PREP 960 Tests P/N: 05235804190 240 Tests P/N: 05235782190 cobas 4800 HPV Amplification/Detection Kit c4800
Læs mereProtokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs merecobas 4800 BRAF V600 Mutation Test BRAF
cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 Tests P/N: 05985536190 cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test BRAF 24 Tests P/N: 05985595190 BEMÆRK: Købet
Læs merecobas 4800 CT/NG Test
cobas 4800 CT/NG Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. BRUGERE MED SYSTEMSOFTWAREVERSION 1.1.2 ELLER NYERE SKAL FØLGE INSTRUKTIONERNE I AFSNIT A. BRUGERE MED SYSTEMSOFTWAREVERSION 2.1 ELLER NYERE SKAL FØLGE INSTRUKTIONERNE
Læs mereTissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP
August 2015 QIAsymphony SPprotokolark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP Dette dokument er Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP QIAsymphony SPprotokolark, R2, til kitversion 1. QIAsymphony
Læs merecobas 4800 HPV Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK.
cobas 4800 HPV Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas 4800 System Sample Preparation Kit c4800 SMPL PREP 960 Tests P/N: 05235804190 240 Tests P/N: 05235782190 cobas 4800 HPV Amplification/Detection Kit c4800
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs merecobas Cdiff Test Til in vitro-diagnostik til brug på cobas 4800-systemet cobas 4800 System Sample Preparation Kit P/N: 05235782190 P/N: 05235804190
til brug på cobas 4800-systemet Til in vitro-diagnostik cobas 4800 System Sample Preparation Kit cobas 4800 System Lysis Kit 1 cobas 4800 System Wash Buffer Kit 240 Tests 960 Tests 240 Tests 960 Tests
Læs merecobas 4800 BRAF V600 Mutation Test BRAF
cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 Tests P/N: 05985536190 cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test BRAF 24 Tests P/N: 05985595190 BEMÆRKNING:
Læs merecobas MRSA/SA Test Til in vitro-diagnostik til brug på cobas 4800-systemet cobas 4800 System Sample Preparation Kit P/N 05235782190 P/N 05235804190
til brug på cobas 4800-systemet Til in vitro-diagnostik cobas 4800 System Sample Preparation Kit cobas 4800 System Lysis Kit 1 cobas 4800 System Wash Buffer Kit 240 Tests 960 Tests 240 Tests 960 Tests
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Oprensning af genomisk DNA fra plantemateriale Manual Katalog nr. 166-5005EDU explorer.bio-rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium, februar 2009
Læs mere72 Tests P/N: 04902068 190 CMV Test PG WR
COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan CMV Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan CMVCAP 72 Tests P/N: 04902068 190 CMV Test COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan 5.1 Liters P/N: 03587797 190 Wash Reagent
Læs mereGAPDH PCR modul Manual
GAPDH PCR modul Manual Katalog nr. 166-5010EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks kassen og læg de pågældende
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereLeucosep rør LTK.615 INDLÆGSSEDDEL. Til diagnostisk anvendelse in vitro PI-LT.615-DK-V3
Leucosep rør LTK.615 INDLÆGSSEDDEL Til diagnostisk anvendelse in vitro PI-LT.615-DK-V3 Vejledende information Tilsigtet anvendelse Leucosep rørene er beregnet til anvendelse i forbindelse med indsamling
Læs merePCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA
PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase
Læs mereLINEAR ARRAY HPV Genotyping Test
LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. AmpliLute Liquid Media Extraction Kit EXTRN 50 Tests P/N: 03750540 190 LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test LA HPV GT 48 Tests P/N: 04391853 190 LINEAR
Læs mereCOBAS AMPLICOR TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK.
COBAS AMPLICOR Chlamydia trachomatis Test CT TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. Bestillingsoplysninger AMPLICOR CT/NG CT/NG PREP 100 Tests P/N: 20759414 122 Specimen Preparation Kit ART: 07 5941 4 US: 83315 AMPLICOR
Læs mereLaboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve
Laboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve Til isolering af genomisk DNA fra indsamlingssætserierne Oragene - og ORAcollect. Du kan finde flere sprog og protokoller på vores webside
Læs mereCOBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HCV Quantitative Test, version 2.0
COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HCV Quantitative Test, version 2.0 TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HCV HCVQTV2 72 Tests P/N: 05532264 190 Quantitative Test, v2.0 COBAS AmpliPrep/COBAS
Læs mereBestillingsoplysninger AMPLICOR CT/NG CT/NG PREP 100 Tests P/N: 20759414 122 Specimen Preparation Kit ART: 07 5941 4 US: 83315
COBAS AMPLICOR Neisseria gonorrhoeaetest NG TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. Bestillingsoplysninger AMPLICOR CT/NG CT/NG PREP 100 Tests P/N: 20759414 122 Specimen Preparation Kit ART: 07 5941 4 US: 83315 AMPLICOR
Læs mereKemiøvelse 2 1. Puffere
Kemiøvelse 2 1 Puffere Øvelsens pædagogiske rammer Sammenhæng Denne øvelse er tilpasset kemiundervisningen på modul 3 ved bioanalytikeruddannelsen. Kemiundervisningen i dette modul indeholder blandt andet
Læs merePuffere. Øvelsens pædagogiske rammer. Sammenhæng. Formål. Arbejdsform: Evaluering
1 Puffere Øvelsens pædagogiske rammer Sammenhæng Denne øvelse er tilpasset kemiundervisningen på modul 3 ved bioanalytikeruddannelsen. Kemiundervisningen i dette modul indeholder blandt andet syrebaseteori
Læs mereKRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE PCR
KRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE Elevvejledning PCR PCR trin for trin PCR involverer en række gentagne cykler, der hver består af følgende tre trin: Denaturering, primer påsætning og forlængelse
Læs mereDNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereQIAsymphony SP-protokolark
Februar 2017 QIAsymphony SP-protokolark circdna_2000_dsp_v1 og circdna_4000_dsp_v1 Dette dokument er QIAsymphony circdna_2000_dsp_v1 og circdna_4000_dsp_v1 protokolark, version 1, R1 Sample to Insight
Læs mereScanGel ReverScan A1, B 86790 2 x 5 ml ReverScan A1, A2, B, O 86795 4 x 5 ml
ScanGel ReverScan A1, B 86790 2 x 5 ml ReverScan A1, A2, B, O 86795 4 x 5 ml HUMANE TESTERYTHROCYTER TIL ABO-SERUMKONTROL IVD Alle de af Bio-Rad producerede og markedsførte produkter gennemgår fra modtagelse
Læs mereDNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereBleach Enhancer for Cleaning
Bleach Enhancer for Cleaning Generel information........................................ 2 Tilsigtet anvendelse........................................ 2 Resumé.................................................
Læs mereBrugsanvisning IVD Matrix HCCA-portioned
Brugsanvisning IVD Matrix HCCA-portioned Rendyrket matrixsubstans til matrix-assisteret-laser-desorption-ionisering time-of-flight-massespektrometri (MALDI-TOF-MS). CARE- produkterne er designet til at
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Genes in a Bottle Kit DNA Extraction Module Lav et halssmykke med dit eget DNA Katalognr.: 166-2000EDU Dertil kan man købe ekstradele, hvis der skal laves halskæder til eleverne.
Læs mereScanGel Monoclonal ABO/RH1/K 86495 48 kort 86485 288 kort
ScanGel Monoclonal ABO/RH1/K 86495 48 kort 86485 288 kort GELER INDEHOLDENDE MONOKLONALE REAGENSER AF MURIN ELLER HUMAN OPRINDELSE ABO1, ABO2, RH1, KEL1 Ag BESTEMMELSE IVD Alle de af Bio-Rad producerede
Læs mereMælkesyrebakterier og holdbarhed
Mælkesyrebakterier og holdbarhed Navn: Forsøgsvejledning Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål med forsøget Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge
Læs mereC V C. Vejledning i brug af Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02. Revision 2. Juli 2014
DOT131v1 Instructions for Use Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Side 1 af 7 Vejledning i brug af Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Revision 2 Juli 2014 DOT131v1
Læs mereRegnskovens hemmeligheder
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Regnskovens hemmeligheder Øvelsesvejledning Formål Et gen for et kræfthelbredende protein er blevet fundet i nogle mystiske blade i regnskoven. Forskere
Læs mereCOBAS TaqMan HBV Test HBV HPS
COBAS TaqMan HBV Test For Use With The High Pure System TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. COBAS TaqMan HBV Test HBV HPS 48 Tests P/N: 03500756 190 High Pure System Viral Nucleic Acid Kit 48 Tests P/N: 03502295
Læs mereMælkesyrebakterier og holdbarhed
Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge holdbarheden af kød ved at: 1. Undersøge forskellen på bakterieantal
Læs mereAnalyse af proteiner Øvelsesvejledning
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Formål At separere og analysere proteiner i almindelige fødevarer ved brug af gelelektroforese. Teori Alle dele
Læs mereAppendix 1: Udregning af mængde cellesuspention til udsåning. Faktor mellem total antal celler og antal celler der ønskes udsås:
Appendix Appendix 1: Udregning af mængde cellesuspention til udsåning Fortyndingsfaktor: Efter trypsinering og centrifugering af celler fra cellestokken, opblandes cellerne i 1 ml medie. For at lave en
Læs merecobas PCR Female Swab Sample Kit
cobas PCR Female Swab Sample Kit TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas PCR Female Swab Sample Kit 100 Packets P/N: 05170516190 TILSIGTET BRUG cobas -kit til PCR-podeprøver fra kvinder bruges til at indsamle og
Læs mereAptima Multitest Swab Specimen Collection Kit
Multitest Swab Specimen Collection Kit Aptima Tilsigtet anvendelse Aptima Multitest Swab Specimen Collection Kit (Aptima Multitest prøvetagningskit til podning) er til brug med Aptima assays. Aptima Multitest
Læs mereMåling af ph i syrer og baser
Kemiøvelse 1 1.1 Måling af ph i syrer og baser Øvelsens pædagogiske rammer Sammenhæng Denne øvelse er tilpasset kemiundervisningen på modul 1 ved bioanalytikeruddannelsen. Øvelsen skal betragtes som en
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere:
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Hvilke baser indgår i DNA? A. Adenin, Guanin, Cytosin,
Læs mereEn forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:
F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT
Læs mereVEJLEDNINGER TIL HURTIG REFERENCE Kun til brug med Sofia Analyzer.
Analyzer og FIA VEJLEDNINGER TIL HURTIG REFERENCE Kun til brug med Sofia Analyzer. Læs indlægssedlen og brugermanualen grundigt før brug af vejledningerne til hurtig reference. Dette er ikke en komplet
Læs mereMælkeskummer. Model Nr: 2137. Generel vejledning om pleje og sikkerhed
Mælkeskummer Model Nr: 2137 Generel vejledning om pleje og sikkerhed Tak, fordi du har valgt en elektrisk mælkeskummer. Apparatet er designet og fremstillet efter høje standarder, og ved korrekt brug og
Læs mereBrugsanvisning. Mælkeskummer DA Brugsanvisning og sikkerhedsbestemmelser. Læs denne vejledning omhyggeligt. Kun til husholdningsbrug.
Brugsanvisning Mælkeskummer 423008 DA Brugsanvisning og sikkerhedsbestemmelser. Læs denne vejledning omhyggeligt. Kun til husholdningsbrug. g DANSK DANSK g SIKKERHEDSFORSKRIFTER Læs denne vejledning, da
Læs mereØvelse med tarmkræftceller i kultur.
Øvelse med tarmkræftceller i kultur. Baggrund Hver 3. dansker bliver ramt af kræft, inden de er blevet 75 år. Tyktarmskræft er den 3. hyppigste kræftform hos både mænd og kvinder, hvor henholdsvis 7.3
Læs mereAnbefalinger for molekylærbiologisk analyse for EGFR mutationer i lunge karcinomer.
Anbefalinger for molekylærbiologisk analyse for EGFR mutationer i lunge karcinomer. Anbefalingerne er baseret på guidelines foreslået af European Society of Pathology (ESP) og er udarbejdet som samarbejde
Læs mereBrugsanvisning for SURVEYOR Scan KRAS Kit Exon 2 CE IVD
1 Producent Brugsanvisning for SURVEYOR Scan KRAS Kit Exon 2 CE IVD for DHPLC systemer Læs venligst denne brugsanvisning grundigt igennem, før dette produkt anvendes. Gem denne brugsanvisning til senere
Læs mereDette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages gerne. Kh Claudia.
Transformation af E.coli K 12 Version 3. marts 2009 (C) Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages
Læs mereKemiøvelse 2 C2.1. Puffere. Øvelsens pædagogiske rammer
Kemiøvelse 2 C2.1 Puffere Øvelsens pædagogiske rammer Sammenhæng Denne øvelse er tilpasset kemiundervisningen på modul 3 ved bioanalytikeruddannelsen. Kemiundervisningen i dette modul indeholder blandt
Læs mereEnVision FLEX, High ph, (Dako Autostainer/Autostainer Plus)
EnVision FLEX, High ph, (Dako Autostainer/Autostainer Plus) Kode K8010 5. udgave Sættet indeholder reagenser til 400 600 analyser. Til Dako Autostainer/Autostainer Plus. Valgfri reagenser: Kode Produktnavn
Læs mereAptima prøvetagningskit til multitestpodning
Tilsigtet brug Aptima prøvetagningskit til multitestpodning er til brug med Aptima assays. Aptima prøvetagningskit til multitestpodning er beregnet til vaginale podningsprøver taget af klinikeren eller
Læs mereFACTOR V LEIDEN KIT. Til brug med LightCycler 1.2-instrumentet. Til in vitro-diagnostik.
REF FACTOR V LEIDEN KIT Til brug med LightCycler 1.2-instrumentet (I EU: Serienummer 2021 til 5602) 03 610 179 001 Kit til 32 reaktioner til højst 30 prøver Til in vitro-diagnostik. DETTE PROGRAM MÅ IKKE
Læs mereELISA Immuno Explorer TM Kit
- 1 - ELISA Immuno Explorer TM Kit Katalog nummer 166-2400EDU Til læreren Dette kit er lavet for at lette og illustrere immunologiundervisningen og kan give en øget forståelse af antigen-antistof interaktionen,
Læs mereIsmaskine BRUGSANVISNING. Model nr V, 50/60Hz Kapacitet: 0,5 liter
Ismaskine Model nr. 1664 220-240V, 50/60Hz Kapacitet: 0,5 liter BRUGSANVISNING 1 Vigtige sikkerhedsforanstaltninger. Ved brug af elektriske apparater er det vigtigt at overholde grundlæggende sikkerhedsforanstaltninger,
Læs mereElevvejledning pglo transformation
Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer
Læs mereElkedel Brugsanvisning
Tillykke med købet af denne elkedel! Læs venligst brugsanvisningen omhyggeligt, inden elkedelen tages i brug, og gem brugsanvisningen til fremtidig brug. Elkedel Brugsanvisning Model: MK-17S17C Sikkerhedsforanstaltninger
Læs mereQIAsymphony SP-protokolark
QIAsymphony SP-protokolark PC_AXpH_HC2_V1_DSP-protokol Tilsigtet anvendelse Til in vitro-diagnostisk brug. Denne protokol er udviklet til brug sammen med cervikalprøver, der opbevares i PreservCyt -opløsning,
Læs mereProbeTec ET Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae Amplified DNA Assays
ProbeTec ET Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae Amplified DNA Assays 3300754JAA 2008/09 Dansk USA patent nr. 5,270,184; 5,547,861; 5,648,211; 5,712,124; 5,744,311; 5,846,726; 5,851,767; 5,866,336;
Læs mereQIAsymphony SP Protokolside
QIAsymphony SP Protokolside Cellfree500_V3_DSP protokol Generel information Til in vitro-diagnostisk brug. Kit Prøvemateriale Protokolnavn QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi-kit Plasma, serum og CSF Cellfree500_V3_DSP
Læs mereProduktion af biodiesel fra rapsolie ved en enzymatisk reaktion
Produktion af biodiesel fra rapsolie ved en enzymatisk reaktion produceres fra rapsolie som består af 95% triglycerider (TG), samt diglycerider (DG), monoglycerider (MG) og frie fedtsyrer (FA). Under reaktionen
Læs mereSTUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER
STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER Navn: Dato:.. MÅL: - Lær om eksistensen af naturlige nanomaterialer - Lysets interaktion med kolloider - Gelatine og mælk som eksempler
Læs mereSikkerhedsark Print dato: SDS-ID:
1. Identifikation af stoffet/blandingen samt af selskabet/virksomheden Produkt navn: See It Red/See It Blue Produktanvendelse: Producent: Oral Karies detector Diafarm A/S Flegmade 1E DK-711 Vejle Danmark
Læs mere7900003 24 analyser Circulating Tumor Cell Control Kit
7900003 24 analyser Circulating Tumor Cell Control Kit 1 TILSIGTET ANVENDELSE Til in vitro-diagnostisk brug CELLSEARCH -kontrolkit til cirkulerende tumorceller er beregnet til brug som analysekontrol for
Læs mereSIKKERHEDSDATABLAD i henhold til EU-Direktiv 2001/58/EF RTV Kit (1.0LBS-0.454KG)
bæres af brandmandskabet. Yderligere information : Standard procedure for kemikalie brande. 6. FORHOLDSREGLER OVER FOR UDSLIP VED UHELD Sikkerhedsforanstaltninger til beskyttelse af personer : Brug personligt
Læs mereBrugsanvisning for SURVEYOR Scan NRAS Kit Exons 2, 3 & 4 CE IVD
1 Producent Brugsanvisning for SURVEYOR Scan NRAS Kit Exons 2, 3 & 4 CE IVD for DHPLC systemer Læs venligst denne brugsanvisning grundigt igennem, før dette produkt anvendes. Gem denne brugsanvisning til
Læs mereBrugsanvisning IVD Matrix HCCA-portioned
Brugsanvisning IVD Matrix HCCA-portioned Rendyrket matrixsubstans til matrix-assisteret-laser-desorption-ionisering time-of-flight-massespektrometri (MALDI-TOF-MS). CARE- produkterne er designet til at
Læs mereTidlig Graviditetstest Stav
DK Tidlig Graviditetstest Stav Brugsanvisning Version 1.0 DK 17012017 Cat.No. W1-M14 10mIU Babyplan Tidlig Graviditetstest er en hurtig graviditetstest som du let kan udføre selv. Den tester for tilstedeværelsen
Læs mereBiotechnology Explorer ELISA Immuno Explorer Kit. Instruktionsmanual
Biotechnology Explorer ELISA Immuno Explorer Kit Instruktionsmanual Katalognummer 166-2400EDU explorer.bio-rad.com Delene i dette kit er sendt i separate æsker. Opbevar posen med reagenser i køleskab indefor
Læs merePROCEDURENS PRINCIPPER BD
ProbeTec ET Chlamydia trachomatis Amplified DNA Assay 3300755JAA 2008/09 Dansk Patent Numbers: 5,270,184; 5,547,861; 5,648,211; 5,712,124; 5,744,311; 5,846,726; 5,851,767; 5,866,336; 5,919,630; 5,928,869;
Læs mereTrin 1: Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid)
Trin 1: Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid) (Denne del tager ca. 3 timer, max 14 prøver) ELEVVEJLEDNING forsøgskasse nr. 1 AAU Oprensning af DNA-prøven foregår gennem fem trin, se figur 1:
Læs mereIsolering af DNA fra løg
Isolering af DNA fra løg Formål: At afprøve en metode til isolering af DNA fra et levende væv. At anvende enzymer.. Indledning: Isolering af DNA fra celler er første trin i mange molekylærbiologiske undersøgelser.
Læs mereSom substrat i forsøgene anvender vi para nitrophenylfosfat, der vha. enzymet omdannes til paranitrofenol
Enzymkinetik Introduktion I disse forsøg skal I arbejde med enzymet alkalisk fosfatase. Fosfataser er meget almindelige i levende organismer og er enzymer med relativt bred substrat specificitet. De katalyserer
Læs mereKvalitetskontrol i molekylærbiologisk rutinediagnostik
i molekylærbiologisk rutinediagnostik Respirationsvejsvirus som model Mette Høgh, cand. scient, ph.d. Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Hvidovre Hospital Mette.hoegh@hvh.regionh.dk Oversigt Introduktion
Læs mereQIAsymphony SP protokolark
QIAsymphony SP protokolark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP Generel information Til in vitro-diagnostisk brug. Disse protokoller er til oprensning af totalt DNA fra væv og formalinfikseret,
Læs mereTissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brugervalideret til QIAsymphony DSP DNA Mini-kit)
August 2015 QIAsymphony SP-protokolark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brugervalideret til QIAsymphony DSP DNA Mini-kit) Dette dokument er Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brugervalideret
Læs mereDato: 03.03.2009 Tidligere dato: --
X SIKKERHEDSDATABLAD OPLYSNINGSSKEMA OM KEMISKE DATA Dato: 03.03.2009 Tidligere dato: 1. IDENTIFIKATION AF STOFFET/PRÆPARATET OG AF SELSKABET/VIRKSOMHEDEN 1.1 Identifikation af stoffet eller præparatet
Læs mereGerningsstedets gåde Den usynlige sandhed - DNA PCR Basics Kit. Katalog nr. 166-2600EDU
1 Gerningsstedets gåde Den usynlige sandhed - DNA PCR Basics Kit Katalog nr. 166-2600EDU Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks pakken og læg de dele, der er mærket med -20
Læs mereSIKKERHEDSDATABLAD (Baseret på EØF direktiv 91/155/ff.)
1. OPLYSNINGER OM STOFFET/MATERIALET OG VIRKSOMHEDEN Produktnavn: Tilsigtet brug Katalognumre LIFECODES LifeScreen Deluxe (LMX) Perlebaseret immunoanalyse til kvalitativ påvisning af IgGantistoffer mod
Læs mereB ProbeTec ET Chlamydia trachomatis Amplified DNA Assay
B ProbeTec ET Chlamydia trachomatis Amplified DNA Assay TILSIGTET BRUG BD ProbeTec ET Chlamydia trachomatis (CT) amplificeret DNA-analyse anvender, når det testes med BD ProbeTec ET systemet, Strand Displacement
Læs mereAdnaTest ProstateCancerSelect
AdnaTest ProstateCancerSelect Berigelse af tumorceller fra blod fra prostatacancerpatienter til genekspressionsanalyse Til in vitro-diagnostisk brug Vejledning T-1-520 Indhold Bestillingsinformation...
Læs mereDNA-smykke Simpel ekstraktion af DNA fra kindceller fra mennesket, som er velegnet til at bruge i et halssmykke
145678 John Schollar and Dean Madden National Centre for Biotechnology Education, University of Reading Science and Technology Centre, Earley Gate, Reading RG6 6BZ UK E: J.W.Schollar@reading.ac.uk Simpel
Læs mereVestsjællands Amtssygehus Klinisk Biokemisk Afdeling Centralsygehuset i Slagelse
Bilag D Vestsjællands Amtssygehus Klinisk Biokemisk Afdeling Centralsygehuset i Slagelse INTERN RAPPORT Afprøvning af Immunofixation af M-komponenter (Bestemmelse af immunoglobulin-klasse og -type) på
Læs mereProtokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs merePRODUKTRESUMÉ. for. Avipro THYMOVAC, lyofilisat til anvendelse i drikkevand
21. december 2009 PRODUKTRESUMÉ for Avipro THYMOVAC, lyofilisat til anvendelse i drikkevand 0. D.SP.NR 08763 1. VETERINÆRLÆGEMIDLETS NAVN Avipro THYMOVAC 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSÆTNING 1 dosis
Læs mere[BESØGSSERVICE INSTITUT FOR MOLEKYLÆRBIOLOGI OG GENETIK, AU]
Enzymkinetik INTRODUKTION Enzymer er biologiske katalysatorer i alle levende organismer som er essentielle for liv. Selektivt og effektivt katalyserer enzymerne kemiske reaktioner som ellers ikke ville
Læs mereSpm. 1.: Hvis den totale koncentration af monomer betegnes med CT hvad er så sammenhængen mellem CT, [D] og [M]?
DNA-smeltetemperaturbestemmelse KemiF2-2008 DNA-smeltetemperaturbestemmelse Introduktion Oligonucleotider er ofte benyttet til at holde nanopartikler sammen med hinanden. Den ene enkeltstreng er kovalent
Læs mereKuvettetest LCK 381 TOC Total organisk kulstof
VIGTIGT NYT! Det aktuelle udgavenummer er nu angivet ved analyseproceduren eller aflæsning. Kuvettetest Princip Total kulstof () og total uorganisk kulstof () bliver gennem oxidation () eller forsuring
Læs mereB ProbeTec ET Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae Amplified DNA Assays
B ProbeTec ET Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae Amplified DNA Assays TILSIGTET BRUG 3300754JAA(01) 2013-11 U 0344 Dansk BD ProbeTec ET Chlamydia trachomatis (CT) and Neisseria gonorrhoeae
Læs mereMaxwell 16 Blood DNA Purification System
Teknisk vejledning Maxwell 16 Blood DNA Purification System Forsigtig - håndter kassettene med omhu, kanterne på forsejlingen kan være skarpe. 2800 Woods Hollow Rd. Madison, WI USA In vitro diagnostisk
Læs mere